More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00772 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  94.51 
 
 		 419 aa  788    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  855    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  83.05 
 
 		 421 aa  678    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  71.36 
 
 		 419 aa  621  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  59.23 
 
 		 421 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  57.76 
 
 		 421 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  56.32 
 
 		 421 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  57.07 
 
 		 421 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  59.95 
 
 		 421 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  55.61 
 
 		 421 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  56.97 
 
 		 421 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  56.72 
 
 		 421 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  56.97 
 
 		 421 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  57.95 
 
 		 421 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  57.7 
 
 		 421 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  48.94 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  46.94 
 
 		 414 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  46.9 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  48.32 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  46.34 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  47.6 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  48.46 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  46.57 
 
 		 412 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  45.69 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  46.84 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  39.64 
 
 		 446 aa  339  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  48.96 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  29.46 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  25.91 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  30.18 
 
 		 400 aa  156  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  28.22 
 
 		 398 aa  150  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  28.19 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  27.46 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  37.16 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  25.28 
 
 		 443 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  25.65 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 		 399 aa  96.7  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  24.34 
 
 		 399 aa  96.3  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 		 435 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  25.07 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  27.4 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  28.85 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  28.21 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  28.22 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  24.26 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  24.11 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  25.71 
 
 		 654 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  24.33 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  28.65 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.86 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  25.33 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  24.55 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.17 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  25.76 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  22.88 
 
 		 657 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  23.42 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  23.84 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 		 775 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  25.35 
 
 		 386 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  21.56 
 
 		 643 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  25.24 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  23.28 
 
 		 663 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  26.06 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  25.16 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.43 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  23.76 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  20.98 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  25.38 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  24.77 
 
 		 654 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  28.82 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  27.56 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  26.76 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  27.56 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  23.27 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  30.19 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  22.88 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  23.55 
 
 		 715 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  30.33 
 
 		 654 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  25.2 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0277  protein of unknown function DUF214  22.43 
 
 		 431 aa  53.9  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  24.36 
 
 		 663 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.15 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  21.99 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  25.2 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  25.66 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  24.26 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  23.25 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1903  hypothetical protein  25.4 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.22 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  21.9 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  24.05 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  25.66 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>