More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1903 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1903  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  849    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1841  hypothetical protein  82.77 
 
 		 437 aa  680    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.521944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2736  ABC transporter permease protein  91.04 
 
 		 418 aa  743    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1472  ABC transporter permease protein  77.26 
 
 		 417 aa  632  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  33.71 
 
 		 452 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0127  protein of unknown function DUF214  35.56 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  34.6 
 
 		 406 aa  222  8e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  36.1 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  32.85 
 
 		 641 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  32.85 
 
 		 641 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  34.06 
 
 		 391 aa  212  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  32.12 
 
 		 648 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  32.12 
 
 		 648 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  32.61 
 
 		 641 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  34.53 
 
 		 653 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  32.12 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 		 406 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  35.42 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  32.05 
 
 		 405 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  37.17 
 
 		 411 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  35.24 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  32.07 
 
 		 443 aa  206  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  35.18 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  32.68 
 
 		 648 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  32.94 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 407 aa  203  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  36.36 
 
 		 661 aa  203  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  32.36 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  30.99 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  33.73 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  32.06 
 
 		 656 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.3 
 
 		 656 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  34.86 
 
 		 405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  36.43 
 
 		 671 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  32.04 
 
 		 647 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  33.49 
 
 		 405 aa  196  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  31.95 
 
 		 405 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  31.41 
 
 		 409 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  32.66 
 
 		 394 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.87 
 
 		 642 aa  196  7e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  32.51 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  32.51 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  33.96 
 
 		 687 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  35.1 
 
 		 653 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  32.13 
 
 		 682 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  32.71 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  32.28 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  32.28 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  32.78 
 
 		 668 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  32.13 
 
 		 667 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  32.13 
 
 		 667 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  32.13 
 
 		 682 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  32.69 
 
 		 409 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  31.1 
 
 		 652 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  33.74 
 
 		 681 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  33.74 
 
 		 681 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  34.21 
 
 		 650 aa  190  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  31.59 
 
 		 650 aa  190  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  31.05 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  31.95 
 
 		 657 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  30.66 
 
 		 649 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  33.17 
 
 		 663 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  32.03 
 
 		 657 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  34.23 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  31.28 
 
 		 668 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  31.28 
 
 		 668 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  32.76 
 
 		 656 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  32.93 
 
 		 653 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  33.33 
 
 		 663 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  31.91 
 
 		 408 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  30.15 
 
 		 647 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  33.66 
 
 		 654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  31.33 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  32.77 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  32.36 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  31.87 
 
 		 653 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  31.87 
 
 		 653 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  33.01 
 
 		 658 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  31.87 
 
 		 653 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  30.19 
 
 		 666 aa  183  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  31.01 
 
 		 410 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.23 
 
 		 678 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  32.94 
 
 		 657 aa  182  7e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  31.23 
 
 		 678 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  30.57 
 
 		 696 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  31.23 
 
 		 678 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  31.48 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  31.98 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  31.78 
 
 		 656 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  33.25 
 
 		 657 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  28.88 
 
 		 643 aa  181  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  34.06 
 
 		 654 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  32.6 
 
 		 644 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.61 
 
 		 648 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  32.93 
 
 		 676 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.3 
 
 		 648 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  34.05 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  33.58 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>