208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1147 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  84.25 
 
 		 400 aa  641    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  785    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  63.04 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  40.55 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  43.63 
 
 		 414 aa  314  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  40.56 
 
 		 418 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  32.03 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  31.49 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  54.02 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  26.76 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  29.27 
 
 		 412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  28.81 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  31.1 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  28.99 
 
 		 421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.63 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  29.83 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  29.9 
 
 		 421 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  29.9 
 
 		 421 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  28.06 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  27.92 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  29.83 
 
 		 421 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  25.47 
 
 		 446 aa  146  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  29.4 
 
 		 421 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  25.96 
 
 		 419 aa  146  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 		 417 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  28.57 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  29.69 
 
 		 421 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  30.08 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  29.06 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  30.36 
 
 		 424 aa  133  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  28.16 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  28.48 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  28.77 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  31.7 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  29.69 
 
 		 425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  31.21 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  31.21 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  28.86 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 		 435 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  37.01 
 
 		 449 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  34.15 
 
 		 472 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  28.34 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  30.32 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.5 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  23.76 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.17 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  23.8 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  24.7 
 
 		 643 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  34.97 
 
 		 775 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  24.09 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  32.97 
 
 		 849 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  24.16 
 
 		 657 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  25.54 
 
 		 656 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  25.99 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  33.51 
 
 		 849 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  24.31 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  22.65 
 
 		 654 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  24.23 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.85 
 
 		 841 aa  57.4  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  23.74 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  24.43 
 
 		 654 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  22.41 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.17 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  27.97 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  28.36 
 
 		 662 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  25.06 
 
 		 654 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  23.02 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  35.66 
 
 		 850 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  23.67 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  23.62 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.83 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  22.93 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  22.49 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  20.3 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  25.11 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  22.74 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  27.73 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  22.25 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  25.44 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2397  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  26.49 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3478  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  21.93 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  27.92 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  23.67 
 
 		 431 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  22.93 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.57 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  43.28 
 
 		 866 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.36 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  20.48 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 861 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  23.3 
 
 		 657 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  24.13 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>