261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1199 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  910    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  41.45 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  42.31 
 
 		 400 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  41 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  37.69 
 
 		 414 aa  297  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  42.68 
 
 		 422 aa  276  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  38.76 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  31.79 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  26.75 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  33.19 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  29.25 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  28.84 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  29.52 
 
 		 421 aa  146  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  29.01 
 
 		 421 aa  146  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  25.44 
 
 		 414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  30.98 
 
 		 421 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  28.82 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  28.23 
 
 		 421 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  28.23 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  30.57 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 		 420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  26.46 
 
 		 425 aa  124  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  28.45 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  36.92 
 
 		 417 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  32.25 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  34.74 
 
 		 419 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  34.9 
 
 		 419 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  35.02 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  31.83 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  36.36 
 
 		 423 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  36.15 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  36.02 
 
 		 399 aa  110  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  36.02 
 
 		 399 aa  110  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  29.16 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  32.12 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  36.82 
 
 		 425 aa  106  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  31.6 
 
 		 410 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  28.64 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  33.64 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  32.97 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  36.46 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  38.99 
 
 		 449 aa  96.7  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  36.57 
 
 		 424 aa  96.3  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  36.32 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  29.44 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  33.13 
 
 		 775 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.82 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  31.82 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  29.1 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.77 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.68 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  29.1 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 		 467 aa  57  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.57 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.01 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14690  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  31.5 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  31.06 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  31.78 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.06 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  34.35 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  27.72 
 
 		 422 aa  54.3  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  33.79 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  33.1 
 
 		 452 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.44 
 
 		 387 aa  53.5  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  29.66 
 
 		 857 aa  53.5  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1065  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.79 
 
 		 439 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.123078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  31.25 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1195  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.79 
 
 		 439 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  29.23 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.87 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  32.48 
 
 		 453 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.61 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.14 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25450  hypothetical protein  28.46 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  25.06 
 
 		 406 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 		 398 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1781  lipoprotein releasing system  32.54 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0490622  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2173  hypothetical protein  27.34 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25430  hypothetical protein  27.34 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  27.82 
 
 		 903 aa  50.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.93 
 
 		 809 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  31.54 
 
 		 488 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  28.46 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.77 
 
 		 417 aa  50.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.91 
 
 		 422 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  28.78 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  28.46 
 
 		 416 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.46 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3628  lipoprotein ABC transporter, permease  25 
 
 		 407 aa  50.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  28.97 
 
 		 858 aa  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  29.13 
 
 		 420 aa  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  29.17 
 
 		 413 aa  50.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  27.56 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  26.92 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.34 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  26.67 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.48 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  31.01 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>