More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0426 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  100 
 
 		 419 aa  850    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  70.64 
 
 		 419 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  71.36 
 
 		 419 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  70.91 
 
 		 421 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  57.52 
 
 		 421 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  58.19 
 
 		 421 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  57.76 
 
 		 421 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  57.95 
 
 		 421 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  57.95 
 
 		 421 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  55.61 
 
 		 421 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  55.61 
 
 		 421 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  57.52 
 
 		 421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  56.56 
 
 		 421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  57.95 
 
 		 421 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  56.23 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  47.52 
 
 		 420 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  47.68 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  48.46 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  49.28 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  47.36 
 
 		 410 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  47.55 
 
 		 412 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  45.32 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  46.67 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  42.08 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  45.85 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  45.96 
 
 		 431 aa  322  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  39.91 
 
 		 446 aa  323  5e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  26.55 
 
 		 449 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  28.27 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  24.41 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  26.28 
 
 		 400 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  28.16 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  26.03 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 435 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 		 420 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  23.79 
 
 		 425 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  33.71 
 
 		 468 aa  94.4  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  23.86 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  26.27 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  21.97 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  21.97 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  22.91 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  26.57 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  26.57 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  22.95 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  22.04 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  25.76 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  26.38 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  31.85 
 
 		 851 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  27.34 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  30 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2173  hypothetical protein  25.74 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.83 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2024  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.43 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2151  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.43 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  26.38 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  31.34 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  27.27 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  25.12 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.77 
 
 		 858 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1696  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  23.27 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.18 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2718  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  23.27 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  23.64 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  23.14 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.84 
 
 		 857 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2201  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  23.27 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1474  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  23.27 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3117  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  23.27 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139824  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  26.19 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2132  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.59 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.435353  normal  0.150883 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  23.44 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  22.33 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  24.91 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  31.87 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2639  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.27 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2584  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.27 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297179  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  24.28 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5963  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.59 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2114  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.59 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  22.65 
 
 		 684 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  22.89 
 
 		 829 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5420  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.19 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  24.63 
 
 		 653 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  24.53 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.91 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  23.25 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  25.24 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  28.37 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1156  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.64 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342008  normal  0.0203303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.49 
 
 		 421 aa  53.9  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  24.69 
 
 		 863 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  32.5 
 
 		 654 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  22.34 
 
 		 378 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  22.65 
 
 		 829 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>