91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4227 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 435 aa  860    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  84.83 
 
 		 420 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  65.06 
 
 		 425 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  60.95 
 
 		 443 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  55.15 
 
 		 420 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  47.97 
 
 		 472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  47.48 
 
 		 449 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  24.66 
 
 		 414 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  30.71 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  30.71 
 
 		 399 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  28.14 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  28.14 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  27.02 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  28.14 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  24.09 
 
 		 446 aa  106  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  29.45 
 
 		 417 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  25.46 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  27.04 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  24.88 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  24.82 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  27.44 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  27.88 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  26.61 
 
 		 418 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  26.79 
 
 		 421 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  26.24 
 
 		 423 aa  99.8  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  26.98 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  25.69 
 
 		 421 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.4 
 
 		 419 aa  96.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  26.11 
 
 		 421 aa  96.7  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  24.77 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  24.42 
 
 		 414 aa  93.6  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  25.87 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  28.53 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  25.9 
 
 		 425 aa  92  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  27.84 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  26.2 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  27.98 
 
 		 468 aa  90.1  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  22.66 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  27.77 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  26.29 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  26.61 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  26.87 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  29.21 
 
 		 1090 aa  55.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  33.6 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 1143 aa  50.8  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  27.53 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  29.84 
 
 		 1130 aa  50.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  24.67 
 
 		 395 aa  50.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3503  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.570589  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 		 833 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2173  hypothetical protein  25.34 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3804  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  32.47 
 
 		 861 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  31.62 
 
 		 451 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  33.6 
 
 		 488 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  26.39 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  22.68 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  26.39 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  26.39 
 
 		 391 aa  46.6  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  26.39 
 
 		 384 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  26.39 
 
 		 391 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  26.39 
 
 		 391 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1851  ABC transporter, permease protein, putative  28 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00637092  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09490  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  33.33 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.457964  normal  0.625524 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  26.39 
 
 		 391 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  26.39 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  26.39 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  31.5 
 
 		 880 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  33.87 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  36.28 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  37.6 
 
 		 854 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  31.96 
 
 		 792 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  26.36 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  28.57 
 
 		 903 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  29.66 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  31.16 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2241  hypothetical protein  34.29 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  25.58 
 
 		 1016 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  25.95 
 
 		 779 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  50 
 
 		 846 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  31.72 
 
 		 853 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  25 
 
 		 383 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  39.71 
 
 		 459 aa  43.5  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  33.03 
 
 		 484 aa  43.5  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  35.71 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  52.08 
 
 		 857 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.17 
 
 		 883 aa  43.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  25.35 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>