More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1851 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1851  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 506 aa  1027    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00637092  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  25.13 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0496  hypothetical protein  25.68 
 
 		 712 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.801522 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  36.52 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  30.22 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2089  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00149352  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  27.27 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3938  hypothetical protein  24.6 
 
 		 713 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4047  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 		 713 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4080  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 		 713 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0939  lipoprotein release system transmembrane protein  25.58 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.866637  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0577  permease, putative  27.43 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.551667  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  28.67 
 
 		 716 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  31.75 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  29.79 
 
 		 696 aa  63.9  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1139  conserved hypothetical integral membrane protein, putative permease  27.22 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  30.07 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  28.67 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  28.67 
 
 		 477 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  28.67 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1860  PglC  26.11 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000429042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  22.84 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.14 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2257  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  20 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  28.67 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.75 
 
 		 640 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  28.67 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  28.67 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  28.67 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  27.72 
 
 		 878 aa  61.6  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  24.89 
 
 		 653 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.93 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  25.45 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  30.6 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  27.66 
 
 		 647 aa  60.5  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  28.25 
 
 		 871 aa  60.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.2 
 
 		 387 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  37.18 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  25.13 
 
 		 952 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  31.11 
 
 		 648 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  25.58 
 
 		 409 aa  60.1  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  33.33 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  25.4 
 
 		 663 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1813  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.99 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0198484  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0692  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  22.22 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.374483  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.08 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.8 
 
 		 859 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  31.43 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  29.73 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  24.31 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  29.63 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  22.05 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  26.13 
 
 		 643 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  28.67 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  29.63 
 
 		 663 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  24.12 
 
 		 662 aa  58.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  28.57 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 833 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  30.58 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.32 
 
 		 656 aa  57.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.27 
 
 		 665 aa  58.2  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  27.73 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  31.85 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01532  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  27.5 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  27.33 
 
 		 821 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003990  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  28.12 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  34.56 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.26 
 
 		 648 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.26 
 
 		 648 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.26 
 
 		 648 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.26 
 
 		 648 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1019  permease, putative  29.12 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.160322  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1164  permease, putative  29.12 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.980068  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  30.95 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.29 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  31.11 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.26 
 
 		 648 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  33.1 
 
 		 859 aa  57  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  27.05 
 
 		 641 aa  57  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  28.99 
 
 		 648 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  28.99 
 
 		 648 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  28.99 
 
 		 648 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  27.94 
 
 		 654 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.34 
 
 		 648 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.99 
 
 		 648 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.99 
 
 		 648 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09060  cell division protein  24.02 
 
 		 305 aa  56.6  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0921919 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  28.99 
 
 		 642 aa  56.2  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.99 
 
 		 648 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  24.2 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  28.37 
 
 		 647 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  28.47 
 
 		 383 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  30.24 
 
 		 401 aa  56.6  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.07 
 
 		 850 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.63 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>