More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0228 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  94.33 
 
 		 388 aa  711    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  96.65 
 
 		 388 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  95.88 
 
 		 388 aa  727    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  96.39 
 
 		 388 aa  726    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  99.23 
 
 		 388 aa  771    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  96.39 
 
 		 388 aa  726    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  81.96 
 
 		 388 aa  634  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  77.26 
 
 		 388 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  76.8 
 
 		 388 aa  617  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  59.17 
 
 		 388 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  62.27 
 
 		 387 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  61.76 
 
 		 387 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  59.43 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  58.14 
 
 		 388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  58.4 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  58.55 
 
 		 388 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  55.64 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  54.33 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.83 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  39.31 
 
 		 440 aa  233  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  36.25 
 
 		 396 aa  226  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  35.92 
 
 		 396 aa  224  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  39.31 
 
 		 431 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  32.69 
 
 		 393 aa  202  9e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  33.8 
 
 		 400 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  33.04 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  29.06 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  27.74 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  29.45 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  25.78 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  27.9 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.74 
 
 		 640 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  27.43 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  27.43 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  23.17 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  25.93 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  27.72 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  30.05 
 
 		 652 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  29.55 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  27.24 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  28.73 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  26.64 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.31 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  29.32 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  39.1 
 
 		 662 aa  77  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  35.26 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.82 
 
 		 642 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  27.74 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  28.79 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  28.36 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  30.33 
 
 		 643 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  26.2 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  26.77 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  29.75 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  29.46 
 
 		 650 aa  73.2  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  25.91 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  28.25 
 
 		 415 aa  72.8  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  27.07 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  27.01 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  27.46 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  29.28 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  27.81 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  36.52 
 
 		 648 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  27.04 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  34.33 
 
 		 696 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  29.96 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.45 
 
 		 842 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  36.52 
 
 		 648 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  36.31 
 
 		 654 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  31.43 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  34.78 
 
 		 642 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  24.4 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  24.25 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  26.28 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  28.05 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  28.71 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  26.24 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  26.36 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  24.9 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  26.27 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  26.02 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  35.85 
 
 		 641 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  30.17 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  24.22 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  27.16 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  35.85 
 
 		 641 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  32.93 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.25 
 
 		 649 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  37.6 
 
 		 647 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  39.66 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  25.88 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.24 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>