More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03340 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  82.56 
 
 		 440 aa  640    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  100 
 
 		 431 aa  839    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  41.73 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  44.21 
 
 		 396 aa  289  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  44.07 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  44.62 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  37.74 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  35.71 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  38.84 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  38.84 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  38.84 
 
 		 388 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.02 
 
 		 388 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  38.57 
 
 		 388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  38.57 
 
 		 388 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  38.02 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  36.09 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  36.64 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  37.07 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  37.36 
 
 		 389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  36.36 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  36.36 
 
 		 400 aa  206  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  35.54 
 
 		 387 aa  202  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  34.16 
 
 		 388 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  36.09 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  34.16 
 
 		 388 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  33.61 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  33.61 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  36.36 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 		 454 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  23.53 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  28.63 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  23.98 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  23.98 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  23.98 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  23.98 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  25 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5104  ABC transporter permease  25.32 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5495  ABC transporter permease  25.32 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  24.5 
 
 		 649 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  23.98 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  24.51 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.73 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  29.44 
 
 		 650 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  25.62 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.07 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  24.83 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  25 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  23.71 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  23.95 
 
 		 650 aa  66.6  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.17 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  24.82 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  26.72 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.08 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  23.76 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  23.37 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  27.33 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  23.43 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  23.86 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.34 
 
 		 649 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  29.12 
 
 		 696 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.39 
 
 		 649 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  26.2 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.66 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.58 
 
 		 648 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.95 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  22.17 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  23.71 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.37 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  26.76 
 
 		 641 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  32.37 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  32.37 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  24.13 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  30.71 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  26.76 
 
 		 641 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  26.29 
 
 		 641 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  32.95 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  30.72 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  25.13 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  26.19 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  21.63 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  26.91 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  28.92 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  26.91 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  22.83 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  31.1 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.24 
 
 		 653 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  25.1 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.24 
 
 		 653 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  27.6 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.24 
 
 		 653 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  30.07 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.03 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  31.21 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>