More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3400 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  82.22 
 
 
388 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  95.88 
 
 
388 aa  727    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
388 aa  777    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  97.42 
 
 
388 aa  735    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  96.13 
 
 
388 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  97.42 
 
 
388 aa  735    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  97.68 
 
 
388 aa  737    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  94.07 
 
 
388 aa  710    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  78.09 
 
 
388 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  77.58 
 
 
388 aa  624  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  62.63 
 
 
387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  63.05 
 
 
387 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  59.69 
 
 
388 aa  461  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  60.21 
 
 
388 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  58.66 
 
 
388 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  58.91 
 
 
388 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  59.33 
 
 
388 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  56.92 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  53.91 
 
 
389 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.56 
 
 
394 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  37.28 
 
 
396 aa  236  7e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  38.44 
 
 
440 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  36.49 
 
 
396 aa  229  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  38.73 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  33.24 
 
 
393 aa  210  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  32.96 
 
 
400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  32.25 
 
 
402 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  29.63 
 
 
395 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 
454 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  27.71 
 
 
371 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  25.61 
 
 
414 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  28.88 
 
 
421 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  26.37 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  26.37 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  27.47 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.65 
 
 
640 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  27.17 
 
 
421 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.29 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  25.93 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  23.08 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.52 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  25.8 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.31 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  29.41 
 
 
662 aa  75.9  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  30.72 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.81 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  29.25 
 
 
652 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.38 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  27.84 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  25.53 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  27.99 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  25.36 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  32.86 
 
 
415 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 
415 aa  72.4  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  27.47 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 
643 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  27.63 
 
 
488 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  34.78 
 
 
642 aa  72  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  23.41 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  26.52 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  27.48 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  25.39 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  25.07 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  32.86 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2024  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.48 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  31.9 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  24.01 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.05 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  26.83 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  27.88 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  26.15 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  26.15 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  25.26 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  31.97 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  27.9 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  25.63 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2132  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.17 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.435353  normal  0.150883 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  23.32 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  25.52 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5963  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.17 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  29.18 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2151  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.17 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738534  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  31.43 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2114  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.17 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08589  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  26.36 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  31.21 
 
 
696 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  20.8 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  23.05 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  25.28 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  35.2 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  26.22 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  26.65 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  25.16 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  24.07 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  38.14 
 
 
403 aa  67  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  32.2 
 
 
642 aa  67  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  26.33 
 
 
398 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>