More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1459 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  770    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  81.44 
 
 		 387 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  80.15 
 
 		 387 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  76.55 
 
 		 388 aa  588  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  77.06 
 
 		 388 aa  586  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  73.45 
 
 		 388 aa  554  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  64.34 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  62.02 
 
 		 388 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  58.4 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  60.21 
 
 		 388 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  59.95 
 
 		 388 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  59.95 
 
 		 388 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  60.21 
 
 		 388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  59.69 
 
 		 388 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  57.62 
 
 		 388 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  59.69 
 
 		 388 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  59.43 
 
 		 388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  59.32 
 
 		 389 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  62.95 
 
 		 391 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  41.22 
 
 		 394 aa  286  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  40.41 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  35.34 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  32.31 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  35.21 
 
 		 440 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  33.71 
 
 		 431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  32.38 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  31.37 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  30.52 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 		 454 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.38 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  28.22 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  23.51 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  22.98 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  27.57 
 
 		 857 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  27 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  26.74 
 
 		 488 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  30.42 
 
 		 415 aa  72  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  24.11 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  22.11 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  30.36 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  23.53 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  26.52 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  24.74 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  34.48 
 
 		 716 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  27.8 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.94 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 		 475 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  28.66 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  35.34 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  33.91 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  28.22 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  27.33 
 
 		 858 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  24.44 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  25.18 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  25.29 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  23.67 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  24.77 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  28.57 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  35.95 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  25.86 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  26.98 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  25.9 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  24.6 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  25.79 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  26.4 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  23.92 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.93 
 
 		 640 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  25.95 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  25.56 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  25.38 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  25.09 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25.53 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  32.24 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  33.33 
 
 		 696 aa  62  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  27.08 
 
 		 652 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  24.6 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  22.85 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  25.94 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  31.54 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1472  ABC transporter permease protein  24.05 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  33.91 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  29.05 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  29.05 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  29.05 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>