163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2258 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
402 aa  768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  79.4 
 
 
400 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  41.49 
 
 
393 aa  261  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  38.71 
 
 
396 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  35.08 
 
 
388 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  35.51 
 
 
388 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.82 
 
 
394 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  34.99 
 
 
388 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  37.6 
 
 
431 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  37.16 
 
 
396 aa  186  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  36.73 
 
 
440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  33.77 
 
 
388 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  34.72 
 
 
388 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  34.55 
 
 
388 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  34.46 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  34.46 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  34.46 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  34.03 
 
 
388 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.94 
 
 
388 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  34.75 
 
 
395 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  33.93 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  34.09 
 
 
389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  34.19 
 
 
388 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  33.42 
 
 
388 aa  159  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  32.21 
 
 
388 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  33.51 
 
 
388 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  32.74 
 
 
387 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  33.93 
 
 
391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  29.79 
 
 
454 aa  83.2  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  27.14 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  26.3 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 
397 aa  60.1  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25.95 
 
 
642 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  30.11 
 
 
295 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  24.9 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  29.75 
 
 
830 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.31 
 
 
648 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 
386 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  23.1 
 
 
389 aa  56.6  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  28.46 
 
 
385 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  26.64 
 
 
409 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  26.09 
 
 
421 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.61 
 
 
649 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 
856 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  30.5 
 
 
696 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.61 
 
 
649 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  27.6 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  31.34 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 
415 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  28.86 
 
 
642 aa  51.2  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  27.7 
 
 
646 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.27 
 
 
437 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  31.34 
 
 
409 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
417 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.54 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.09 
 
 
646 aa  50.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  28.98 
 
 
842 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  22.64 
 
 
391 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  22.64 
 
 
391 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  22.64 
 
 
391 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  22.64 
 
 
383 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  23.77 
 
 
419 aa  50.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  24.92 
 
 
414 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  29.5 
 
 
407 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  27.65 
 
 
412 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  23.87 
 
 
649 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  27.5 
 
 
488 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  25.3 
 
 
658 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 
409 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  24.77 
 
 
652 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  25 
 
 
648 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0218  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  25 
 
 
648 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  24.68 
 
 
651 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  26.81 
 
 
687 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  25.35 
 
 
404 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  26.64 
 
 
418 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.28 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  31.31 
 
 
844 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  25.48 
 
 
400 aa  47.8  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  26.07 
 
 
400 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  27.44 
 
 
403 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  23.69 
 
 
641 aa  47.4  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 
386 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  24.61 
 
 
647 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.81 
 
 
382 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  26.92 
 
 
409 aa  47  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  35.88 
 
 
456 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  22.35 
 
 
391 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  31.48 
 
 
841 aa  47  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  23.61 
 
 
405 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  26.81 
 
 
373 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  30.51 
 
 
668 aa  47  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  30.51 
 
 
668 aa  47  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  24.28 
 
 
421 aa  46.6  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25.24 
 
 
640 aa  46.6  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.74 
 
 
385 aa  46.6  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0223  hypothetical protein  28.41 
 
 
401 aa  46.6  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  22.41 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>