More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0218 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0218  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
379 aa  723    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2967  hypothetical protein  79.42 
 
 
381 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1376  hypothetical protein  44.91 
 
 
386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  28.53 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  29.78 
 
 
643 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.15 
 
 
397 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  24.5 
 
 
397 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  25.19 
 
 
397 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  24.57 
 
 
397 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  27.92 
 
 
404 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 
406 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  23.96 
 
 
397 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  27.72 
 
 
654 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.74 
 
 
387 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  28.81 
 
 
402 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  28 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  29.03 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  29.98 
 
 
410 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 
405 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 
386 aa  96.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  29.21 
 
 
416 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  24.38 
 
 
397 aa  95.9  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  27.08 
 
 
407 aa  95.9  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  23.51 
 
 
397 aa  95.9  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  27.95 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  27.92 
 
 
651 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.44 
 
 
413 aa  94.4  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  25.59 
 
 
409 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  24.33 
 
 
402 aa  93.6  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  27.95 
 
 
657 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  25.66 
 
 
404 aa  93.2  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  28.17 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  23.25 
 
 
397 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  25.66 
 
 
404 aa  92.8  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  28.54 
 
 
654 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  28.78 
 
 
666 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  24.77 
 
 
414 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  28.14 
 
 
657 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  26.02 
 
 
409 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  25.32 
 
 
390 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  26.67 
 
 
381 aa  90.5  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  27.74 
 
 
402 aa  90.5  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  24.54 
 
 
414 aa  90.1  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  30.27 
 
 
652 aa  90.1  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 
406 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  27.8 
 
 
650 aa  89.7  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26 
 
 
649 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25.89 
 
 
443 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  26.54 
 
 
386 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  24.77 
 
 
415 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  24.74 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  28.89 
 
 
656 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  25.61 
 
 
656 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  29.21 
 
 
415 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.53 
 
 
649 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  22.94 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  24.15 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  25.49 
 
 
401 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  25.74 
 
 
407 aa  86.7  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  27.72 
 
 
401 aa  86.7  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  26.33 
 
 
399 aa  86.7  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  27.7 
 
 
663 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  25.97 
 
 
405 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  26.54 
 
 
651 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  25.42 
 
 
409 aa  86.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  25.67 
 
 
395 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.75 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  25.38 
 
 
645 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  22.73 
 
 
652 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  24.21 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  27.74 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  25.06 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  24.2 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  25.24 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  26.52 
 
 
644 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 
404 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  25.61 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 
415 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  29.14 
 
 
654 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.54 
 
 
648 aa  83.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  23.35 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  29.12 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  25.06 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 
406 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0943  ABC transporter component-like protein  34.62 
 
 
452 aa  82.8  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000599069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  26.49 
 
 
663 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 
408 aa  82.8  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26 
 
 
648 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  26 
 
 
648 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  26 
 
 
648 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26 
 
 
648 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26 
 
 
648 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 
412 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  26 
 
 
648 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  21.83 
 
 
662 aa  82.4  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.73 
 
 
646 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>