More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2967 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2967  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  721    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0218  protein of unknown function DUF214  79.42 
 
 
379 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181881 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1376  hypothetical protein  45.31 
 
 
386 aa  237  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  29.06 
 
 
371 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  30.3 
 
 
643 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  27.95 
 
 
386 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25.66 
 
 
405 aa  106  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  29.06 
 
 
399 aa  106  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.51 
 
 
397 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  27.59 
 
 
409 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  28.16 
 
 
414 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  27.88 
 
 
414 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  26.73 
 
 
406 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  25.63 
 
 
652 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 
406 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.59 
 
 
649 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25 
 
 
648 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  26.43 
 
 
443 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 
406 aa  99.8  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  26.18 
 
 
696 aa  99.8  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  26.9 
 
 
415 aa  99.8  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  24.82 
 
 
397 aa  99.8  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  24.28 
 
 
402 aa  99  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25.36 
 
 
642 aa  98.6  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  27.18 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  29.1 
 
 
654 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  30.12 
 
 
666 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  26.09 
 
 
409 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  27.39 
 
 
651 aa  97.1  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  27.27 
 
 
407 aa  97.4  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.12 
 
 
649 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  27.87 
 
 
667 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  27.87 
 
 
667 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  24.5 
 
 
397 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.29 
 
 
665 aa  96.7  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.35 
 
 
387 aa  96.7  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  27.57 
 
 
409 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  29.32 
 
 
654 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  26.59 
 
 
412 aa  95.9  9e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  28.35 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  26.22 
 
 
648 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  26.22 
 
 
648 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  27.63 
 
 
682 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  24.81 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  29.7 
 
 
657 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  28.15 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  27.63 
 
 
682 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  30.1 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  27.54 
 
 
399 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  27.32 
 
 
644 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  27.54 
 
 
648 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  25.63 
 
 
645 aa  94.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  26.94 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.68 
 
 
387 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  28.99 
 
 
663 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.01 
 
 
413 aa  93.6  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  26.94 
 
 
404 aa  93.6  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  28.33 
 
 
656 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  27.82 
 
 
405 aa  92.8  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  23.1 
 
 
397 aa  92.8  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.65 
 
 
391 aa  92.8  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  27.56 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  24.88 
 
 
653 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 
467 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  27.91 
 
 
402 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.1 
 
 
656 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  25.94 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  28.22 
 
 
404 aa  91.3  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 
404 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.93 
 
 
648 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  23.1 
 
 
397 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  23.38 
 
 
397 aa  90.9  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  26.85 
 
 
668 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  26.54 
 
 
647 aa  90.5  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  26.37 
 
 
410 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.74 
 
 
648 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 
853 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  27.91 
 
 
663 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  26.81 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.65 
 
 
648 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  24.32 
 
 
396 aa  89.7  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  26.86 
 
 
656 aa  89.7  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  27.34 
 
 
652 aa  89.7  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25.98 
 
 
642 aa  89.7  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.76 
 
 
646 aa  89.4  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  25.74 
 
 
648 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  25.74 
 
 
648 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  28.64 
 
 
397 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  29.16 
 
 
402 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  25.74 
 
 
648 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  25.63 
 
 
650 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  30.89 
 
 
381 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.66 
 
 
648 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.74 
 
 
648 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  25.93 
 
 
410 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.74 
 
 
648 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  26.02 
 
 
649 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  27.54 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>