More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2537 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2537  hypothetical protein  100 
 
 		 793 aa  1589    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.22202  hitchhiker  0.0000000191831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  82.37 
 
 		 828 aa  1253    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  41.33 
 
 		 821 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  39.8 
 
 		 796 aa  495  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  21.78 
 
 		 842 aa  88.6  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  32.64 
 
 		 855 aa  86.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  23.08 
 
 		 847 aa  85.5  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  23.86 
 
 		 775 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.46 
 
 		 854 aa  79  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  22.88 
 
 		 848 aa  76.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.32 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  28.3 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  28.1 
 
 		 397 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  24.05 
 
 		 806 aa  73.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  26.4 
 
 		 452 aa  73.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  28.87 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  25.09 
 
 		 414 aa  70.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  27 
 
 		 397 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 		 443 aa  70.1  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  23.92 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  26.34 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  25.66 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  25.5 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.65 
 
 		 656 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  22.61 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 		 852 aa  68.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  32.14 
 
 		 656 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  22.09 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.06 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  23.75 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  29.89 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  31.82 
 
 		 682 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  30.68 
 
 		 652 aa  67.4  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  21.92 
 
 		 430 aa  67  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  31.82 
 
 		 667 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  31.82 
 
 		 667 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  31.82 
 
 		 682 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  23.38 
 
 		 394 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  30.66 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  33.55 
 
 		 647 aa  66.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  22.38 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  30.15 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  30.57 
 
 		 652 aa  65.1  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.44 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.13 
 
 		 843 aa  65.1  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  20.42 
 
 		 861 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  21.51 
 
 		 805 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  30.08 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  25.39 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  20.51 
 
 		 792 aa  64.3  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  27.85 
 
 		 383 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  28.98 
 
 		 696 aa  63.9  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  21.44 
 
 		 773 aa  63.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  33.59 
 
 		 652 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  27.01 
 
 		 400 aa  63.5  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  25.12 
 
 		 413 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  23.55 
 
 		 430 aa  63.5  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  23.01 
 
 		 424 aa  63.5  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.03 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  23.66 
 
 		 869 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  29.07 
 
 		 896 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  33.08 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.67 
 
 		 653 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 385 aa  63.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.62 
 
 		 641 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  23.57 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  27.43 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  26.4 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  23.84 
 
 		 797 aa  62.4  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.13 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.33 
 
 		 642 aa  62  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  35 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  35 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  35 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  23.66 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  35 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  23.95 
 
 		 863 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  23.97 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  27.23 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  21.71 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 		 853 aa  61.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  28.14 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  25.35 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.18 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  20.92 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  21.48 
 
 		 804 aa  61.2  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  21.29 
 
 		 855 aa  61.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  25.9 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  29.02 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  27.39 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  35.82 
 
 		 645 aa  60.8  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  30.21 
 
 		 648 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.29 
 
 		 653 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  26.4 
 
 		 397 aa  60.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  23.04 
 
 		 809 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  30.21 
 
 		 648 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  27.32 
 
 		 407 aa  60.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>