226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1985 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  779    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  69.61 
 
 		 385 aa  545  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  68.57 
 
 		 385 aa  529  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  65.19 
 
 		 385 aa  511  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  60.26 
 
 		 385 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  60 
 
 		 385 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  57.29 
 
 		 386 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  58.05 
 
 		 383 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  54.81 
 
 		 385 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  55.58 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  55.84 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  55.84 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  55.84 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  55.58 
 
 		 384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  55.32 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  55.32 
 
 		 384 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  55.32 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  52.73 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  55.06 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.59 
 
 		 382 aa  236  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  38.14 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  34.4 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  37.53 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  35.75 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  37.42 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  33.51 
 
 		 385 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  30.14 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  30.14 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3165  protein of unknown function DUF214  25.89 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.296163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  24.69 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  26.17 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2395  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  24.31 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  22.04 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  20.92 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  28.81 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  23.78 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  21.78 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  23.78 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.92 
 
 		 848 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  27.87 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  23.51 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  25.6 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  22.22 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  22.36 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  22.7 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  29.37 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  24.76 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.19 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  26.74 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  24.07 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  21.58 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  29.55 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.19 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  22.57 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  31.19 
 
 		 852 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  31.5 
 
 		 421 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 		 452 aa  53.5  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  20.89 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1678  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.56 
 
 		 421 aa  53.5  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0156822  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1332  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  23.15 
 
 		 411 aa  53.1  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  21.59 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  22.63 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.26 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.61 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 		 466 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  20.62 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  34.65 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  29.77 
 
 		 873 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  34.88 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  28.83 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  35.16 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  22.78 
 
 		 846 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  35.16 
 
 		 825 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  22.56 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  31.45 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  27.69 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  21.6 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  25.42 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  21.01 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  25.58 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  23.89 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  22.08 
 
 		 850 aa  50.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.64 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3231  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.81 
 
 		 422 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113164  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5136  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.81 
 
 		 422 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  33.08 
 
 		 386 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.14 
 
 		 414 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2259  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC, putative  21.65 
 
 		 416 aa  49.7  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  20.96 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.4 
 
 		 386 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2151  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.74 
 
 		 417 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738534  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  21.71 
 
 		 419 aa  49.7  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.98 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>