More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0818 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  778    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  50.39 
 
 
387 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  41.08 
 
 
385 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  36.08 
 
 
385 aa  233  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  34.2 
 
 
388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  35.82 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  34.55 
 
 
385 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.25 
 
 
382 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  34.29 
 
 
385 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  34.81 
 
 
384 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  33.76 
 
 
383 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  35.64 
 
 
384 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  35.64 
 
 
384 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  35.53 
 
 
384 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  35.37 
 
 
384 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  35.64 
 
 
384 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  32.99 
 
 
385 aa  205  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  31.7 
 
 
385 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.37 
 
 
384 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  34.5 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  33.91 
 
 
385 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  33.51 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  37.82 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  37.63 
 
 
379 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  36.7 
 
 
384 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  31.17 
 
 
385 aa  190  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  33.33 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  35.49 
 
 
384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  25.95 
 
 
849 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  33.33 
 
 
663 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  31.79 
 
 
663 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  30.77 
 
 
657 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  27.23 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  30.96 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  30.77 
 
 
654 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  38.6 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  23.4 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  29.53 
 
 
654 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  24.9 
 
 
836 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  25.8 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  23.75 
 
 
849 aa  63.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  34.4 
 
 
414 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  24.5 
 
 
861 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  27.42 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  26.06 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  23.35 
 
 
397 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  37.72 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  32.81 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  29.9 
 
 
656 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  30.23 
 
 
414 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  33.77 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  30.5 
 
 
657 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  34.51 
 
 
396 aa  60.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  32.89 
 
 
467 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  32.35 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  25.1 
 
 
430 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  37.04 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  30.77 
 
 
413 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  29.66 
 
 
417 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  36.61 
 
 
423 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  30.77 
 
 
656 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  26.22 
 
 
398 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  32.72 
 
 
404 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  29.53 
 
 
654 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
848 aa  56.2  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  29.7 
 
 
412 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 
421 aa  56.2  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.4 
 
 
641 aa  55.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  27.63 
 
 
466 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 
414 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
463 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  26.51 
 
 
414 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  24.77 
 
 
388 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  33.33 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  31.47 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 
417 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.45 
 
 
664 aa  56.2  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  28 
 
 
930 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  30.81 
 
 
457 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  29.87 
 
 
443 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  32.88 
 
 
449 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  25.9 
 
 
421 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  32.8 
 
 
647 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  25.37 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  27.38 
 
 
854 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  26.04 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  29.51 
 
 
407 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 
386 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  30.69 
 
 
402 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  27.18 
 
 
645 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  35.58 
 
 
415 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  36.03 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  35.96 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  24.1 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  27.87 
 
 
400 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.08 
 
 
437 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  25.37 
 
 
885 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  26.61 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  28.69 
 
 
411 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>