180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3401 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
384 aa  770    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  97.4 
 
 
384 aa  705    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  95.83 
 
 
384 aa  702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  97.4 
 
 
384 aa  707    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  95.57 
 
 
384 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  97.4 
 
 
384 aa  707    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  94.01 
 
 
384 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  80.21 
 
 
384 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  80.99 
 
 
384 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  79.43 
 
 
384 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  56.1 
 
 
385 aa  428  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  55.32 
 
 
385 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  54.69 
 
 
386 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  55.84 
 
 
385 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  55.38 
 
 
383 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  55.32 
 
 
385 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  55.58 
 
 
385 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  53.25 
 
 
385 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  50.13 
 
 
385 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.25 
 
 
382 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  36.39 
 
 
385 aa  216  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  36.69 
 
 
385 aa  212  9e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  34.63 
 
 
385 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  32.65 
 
 
387 aa  200  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  34.2 
 
 
385 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  33.02 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  30.15 
 
 
379 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  30.13 
 
 
379 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  21.8 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.48 
 
 
420 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.65 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3165  protein of unknown function DUF214  23.74 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.296163  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  24.28 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.28 
 
 
854 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.93 
 
 
848 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  26.57 
 
 
425 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.3 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  23.51 
 
 
419 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.09 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  23.29 
 
 
397 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.09 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  28.95 
 
 
414 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  22.17 
 
 
397 aa  53.5  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  24.08 
 
 
420 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1012  hypothetical protein  29.22 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000255652 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  28.32 
 
 
414 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  29.11 
 
 
853 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  22.89 
 
 
851 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.79 
 
 
434 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  24.57 
 
 
422 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  27.27 
 
 
371 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  20.06 
 
 
868 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.66 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.66 
 
 
416 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  24.8 
 
 
828 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.57 
 
 
422 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.53 
 
 
434 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  23.83 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  23.49 
 
 
378 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.65 
 
 
656 aa  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  23.08 
 
 
397 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.9 
 
 
857 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.86 
 
 
805 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  24.38 
 
 
409 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  20.85 
 
 
397 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  22.25 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  29.27 
 
 
798 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.56 
 
 
843 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  20.62 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  29.95 
 
 
647 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.82 
 
 
930 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  19.34 
 
 
858 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.77 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  33.86 
 
 
656 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1449  hypothetical protein  27.92 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  22.16 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  25.36 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  24.47 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  32.14 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  29.17 
 
 
861 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  23.77 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  23.87 
 
 
403 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  24.13 
 
 
407 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  27.92 
 
 
821 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  23.33 
 
 
419 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  34.38 
 
 
873 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  19.23 
 
 
876 aa  47  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  26.09 
 
 
414 aa  46.6  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.57 
 
 
394 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  23.04 
 
 
395 aa  47  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  27.43 
 
 
415 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  21.03 
 
 
402 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  21.05 
 
 
454 aa  46.6  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  23.74 
 
 
405 aa  46.6  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  26.95 
 
 
415 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  28.93 
 
 
642 aa  46.6  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>