105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2022 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  781    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  43.63 
 
 		 385 aa  294  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  39.58 
 
 		 387 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  37.11 
 
 		 385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  36.08 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.42 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  34.73 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  33.59 
 
 		 385 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  35.23 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  35.78 
 
 		 385 aa  207  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  33.96 
 
 		 385 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  31.27 
 
 		 385 aa  193  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  32.75 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  31.97 
 
 		 384 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  32.17 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  29.97 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  29.97 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  31.59 
 
 		 384 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.88 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  30.75 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  34.15 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  31.59 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  31.59 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  32.32 
 
 		 384 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  30.43 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  33.02 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  31.09 
 
 		 379 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  25.08 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  28.47 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25 
 
 		 843 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  24.14 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  26.87 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 		 855 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  25.76 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  25.39 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  35.04 
 
 		 413 aa  53.9  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  22.69 
 
 		 855 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  21.37 
 
 		 842 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  27.59 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  24.89 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  28.19 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  26.04 
 
 		 847 aa  51.2  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.84 
 
 		 835 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  28.26 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  27.5 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  28.37 
 
 		 1132 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25430  hypothetical protein  24.82 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.76 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  32.63 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2173  hypothetical protein  24.82 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 866 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1468  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.09 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  25.2 
 
 		 654 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  34.44 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.2 
 
 		 805 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.91 
 
 		 424 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  21 
 
 		 416 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  23.66 
 
 		 654 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.4 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  25.45 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 		 1132 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1609  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.49 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0146346  normal  0.0646675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  22.41 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  31.36 
 
 		 850 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  30.84 
 
 		 885 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  24.14 
 
 		 853 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 878 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3165  protein of unknown function DUF214  23.55 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.296163  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  28.79 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  26.07 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  29.17 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  23.68 
 
 		 839 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  24.09 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  35.58 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  25.64 
 
 		 856 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  32.11 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  32.32 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  35.79 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  21.3 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  23.93 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  22.58 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  22.48 
 
 		 656 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  30 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  31.48 
 
 		 789 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  31.48 
 
 		 789 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 		 873 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  29.33 
 
 		 467 aa  43.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  29.29 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  24.75 
 
 		 838 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 		 861 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  29.29 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  29.29 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  29.29 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  29.29 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  29.29 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  29.29 
 
 		 383 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0746  putative ABC transport system permease protein  30.77 
 
 		 403 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.489511 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>