290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2259 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
379 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  82.85 
 
 
379 aa  587  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  36.18 
 
 
387 aa  202  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  36.29 
 
 
385 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  36.1 
 
 
385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  30.75 
 
 
388 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.69 
 
 
382 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 
385 aa  146  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  30.48 
 
 
385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  31.38 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  30.93 
 
 
385 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 
385 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  30.72 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  30.14 
 
 
385 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  29.77 
 
 
384 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.17 
 
 
384 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  29.74 
 
 
383 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  28.99 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  29.65 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  30.42 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  30.42 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  29.65 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  30.14 
 
 
385 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  31.45 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  29.4 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  29.94 
 
 
384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  28.76 
 
 
385 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  29.38 
 
 
384 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  26.54 
 
 
861 aa  66.2  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 
853 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  23.96 
 
 
388 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  27.41 
 
 
395 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  30.73 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  27.88 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  37.4 
 
 
668 aa  60.1  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  37.4 
 
 
668 aa  60.1  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  24.35 
 
 
430 aa  59.7  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  34.33 
 
 
462 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  25.49 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  34.43 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  34.43 
 
 
421 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  26.87 
 
 
384 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  27.95 
 
 
847 aa  56.6  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  25.86 
 
 
388 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  25.86 
 
 
388 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  35.25 
 
 
421 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  25.81 
 
 
388 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  34.43 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.77 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  25.62 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  26.17 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  26.94 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
466 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  37.4 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  26.03 
 
 
383 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  33.96 
 
 
415 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  26.48 
 
 
391 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  25.93 
 
 
414 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  25.31 
 
 
384 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.83 
 
 
437 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  25.89 
 
 
400 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  25.51 
 
 
391 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  30.26 
 
 
391 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  30.26 
 
 
391 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  30.26 
 
 
383 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.68 
 
 
388 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  30.26 
 
 
391 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.34 
 
 
640 aa  53.5  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  30.26 
 
 
391 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  27.2 
 
 
417 aa  53.1  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  34.43 
 
 
656 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 
852 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  26.35 
 
 
394 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  27.94 
 
 
839 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  28.44 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.43 
 
 
656 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  24.57 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  30.07 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 
404 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  31.74 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  23.79 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  28.02 
 
 
452 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  32.79 
 
 
647 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  36.21 
 
 
453 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.24 
 
 
855 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  33.08 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.68 
 
 
646 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  37.17 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.48 
 
 
412 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.91 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  25.46 
 
 
401 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  32.79 
 
 
417 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  33.64 
 
 
410 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  32.37 
 
 
477 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  33.33 
 
 
696 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  31.97 
 
 
682 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.14 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  31.97 
 
 
667 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>