115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3710 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  780    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  83.59 
 
 		 384 aa  627  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  80.99 
 
 		 384 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  80.47 
 
 		 384 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  80.99 
 
 		 384 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  80.99 
 
 		 384 aa  614  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  80.73 
 
 		 384 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  79.43 
 
 		 384 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  83.33 
 
 		 384 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  80.21 
 
 		 384 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  56.88 
 
 		 385 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  56.36 
 
 		 385 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  56.51 
 
 		 386 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  55.84 
 
 		 385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  55.06 
 
 		 385 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  54.59 
 
 		 383 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  54.81 
 
 		 385 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  52.99 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  49.09 
 
 		 385 aa  364  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.47 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  35.69 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  34.37 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  38.99 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  33.68 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  30.48 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  31.27 
 
 		 388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 		 379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 		 379 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.86 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  23.86 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  35.4 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  20.9 
 
 		 876 aa  54.3  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 		 848 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  32.67 
 
 		 400 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.02 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.57 
 
 		 419 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.12 
 
 		 394 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  21.12 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  24.4 
 
 		 855 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3165  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.296163  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  32.05 
 
 		 930 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  22.07 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  24.15 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  23.51 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  21.75 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  31.15 
 
 		 842 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  20.66 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  21.08 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  26.54 
 
 		 853 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.69 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.48 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  24.36 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  27.01 
 
 		 477 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  23.21 
 
 		 787 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  20.9 
 
 		 397 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  30.72 
 
 		 475 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 436 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  23.92 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  27.48 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.55 
 
 		 838 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  22.43 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  24.76 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  27.09 
 
 		 836 aa  46.2  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.26 
 
 		 854 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  25.64 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  26.76 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  22.95 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  25.53 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  24.07 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  25.24 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  21.15 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  22.73 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  23.79 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  29.48 
 
 		 805 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  32.03 
 
 		 873 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  27.17 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2395  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  25.79 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  24.33 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  20.99 
 
 		 419 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  22.97 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 		 475 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  27.19 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1468  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.94 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  25 
 
 		 828 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  23.81 
 
 		 863 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  21.53 
 
 		 789 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 		 475 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  21.55 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 		 475 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 		 475 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  23.66 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 		 475 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  22.12 
 
 		 409 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  26.96 
 
 		 800 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  24.25 
 
 		 873 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  30.46 
 
 		 716 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  29.19 
 
 		 416 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>