89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1941 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  100 
 
 		 787 aa  1572    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  57.05 
 
 		 793 aa  839    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  55.25 
 
 		 790 aa  761    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  46.4 
 
 		 787 aa  637    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  55.89 
 
 		 788 aa  824    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  44.68 
 
 		 787 aa  632  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  41.33 
 
 		 788 aa  593  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  44.19 
 
 		 790 aa  590  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  42.97 
 
 		 787 aa  580  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  43.13 
 
 		 788 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  42.52 
 
 		 793 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  40.56 
 
 		 787 aa  569  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  42.62 
 
 		 800 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  42.84 
 
 		 789 aa  557  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  41.06 
 
 		 787 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  42.41 
 
 		 787 aa  554  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  40.08 
 
 		 787 aa  555  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  40.1 
 
 		 788 aa  535  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  40.68 
 
 		 786 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  38.91 
 
 		 787 aa  522  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  38.31 
 
 		 787 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  38.15 
 
 		 789 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  38.12 
 
 		 789 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  38.12 
 
 		 789 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  39.42 
 
 		 787 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  39.97 
 
 		 791 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  39.04 
 
 		 787 aa  499  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  40.89 
 
 		 786 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  40.75 
 
 		 786 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  38.35 
 
 		 789 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  40.63 
 
 		 786 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  36.5 
 
 		 787 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  37.85 
 
 		 788 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  37.45 
 
 		 793 aa  451  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  37.64 
 
 		 787 aa  442  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  38.74 
 
 		 786 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  36.51 
 
 		 789 aa  399  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  29.79 
 
 		 792 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  30.26 
 
 		 791 aa  340  5.9999999999999996e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 		 792 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 		 792 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  28.59 
 
 		 787 aa  260  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 		 797 aa  257  7e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 		 774 aa  158  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  24.82 
 
 		 947 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  23.81 
 
 		 1132 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  23.23 
 
 		 1132 aa  137  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  20.84 
 
 		 773 aa  136  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1090 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  23.57 
 
 		 868 aa  130  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  26.64 
 
 		 1177 aa  125  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  22.85 
 
 		 1016 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  24.53 
 
 		 1110 aa  113  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  21.62 
 
 		 876 aa  107  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  26.2 
 
 		 1232 aa  102  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  21.25 
 
 		 1143 aa  100  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  22.99 
 
 		 759 aa  99.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.52 
 
 		 737 aa  99.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  20.7 
 
 		 859 aa  91.7  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  22.6 
 
 		 917 aa  88.6  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  24.78 
 
 		 806 aa  87.8  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.65 
 
 		 1211 aa  85.5  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  21.86 
 
 		 743 aa  83.2  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  18.36 
 
 		 1068 aa  81.3  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  24.73 
 
 		 876 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.16 
 
 		 855 aa  57  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  25.2 
 
 		 389 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  25.86 
 
 		 839 aa  53.9  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.92 
 
 		 854 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  26.39 
 
 		 414 aa  52  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  25.31 
 
 		 806 aa  51.2  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  29.84 
 
 		 393 aa  51.2  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  21.77 
 
 		 851 aa  48.5  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  23.83 
 
 		 856 aa  48.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 		 383 aa  47.8  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  22.36 
 
 		 842 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  21.92 
 
 		 870 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  24.39 
 
 		 821 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  24.02 
 
 		 838 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2228  ABC transporter, permease  21.7 
 
 		 779 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.622849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  21.58 
 
 		 749 aa  45.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0511  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1753 aa  44.7  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.665267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  34.23 
 
 		 842 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2512  ABC transporter, permease protein  20.71 
 
 		 775 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00525405  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  30.83 
 
 		 846 aa  44.7  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  34.74 
 
 		 355 aa  44.3  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1244  hypothetical protein  19.65 
 
 		 772 aa  44.3  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 		 416 aa  44.3  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 		 834 aa  43.9  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>