114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2063 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  47.55 
 
 		 793 aa  652    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 786 aa  1547    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  45.62 
 
 		 787 aa  643    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  50.06 
 
 		 787 aa  711    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  47.84 
 
 		 787 aa  682    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  47.78 
 
 		 789 aa  627  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  41.42 
 
 		 791 aa  588  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  39.01 
 
 		 787 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  40.41 
 
 		 787 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  40.66 
 
 		 787 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  40.23 
 
 		 789 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  42.84 
 
 		 787 aa  565  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  40.05 
 
 		 787 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  39.26 
 
 		 787 aa  558  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  39.48 
 
 		 788 aa  549  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  35.29 
 
 		 788 aa  539  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  41.79 
 
 		 793 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  38.88 
 
 		 787 aa  539  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  40.28 
 
 		 787 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  39.85 
 
 		 788 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  40.68 
 
 		 787 aa  524  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  38.07 
 
 		 789 aa  522  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  38.07 
 
 		 789 aa  522  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  41.09 
 
 		 788 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  39.49 
 
 		 788 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  39.77 
 
 		 789 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  38.99 
 
 		 800 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  39.54 
 
 		 787 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  39.64 
 
 		 790 aa  500  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  38.94 
 
 		 793 aa  489  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  41.04 
 
 		 786 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 		 786 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  40.1 
 
 		 790 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  41.04 
 
 		 786 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  38.86 
 
 		 787 aa  458  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  41.51 
 
 		 786 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  37.83 
 
 		 789 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  31.42 
 
 		 791 aa  352  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  29.43 
 
 		 792 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  27.94 
 
 		 792 aa  317  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  28.96 
 
 		 792 aa  300  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  31.11 
 
 		 787 aa  281  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  27.75 
 
 		 797 aa  274  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  25.65 
 
 		 774 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  24.96 
 
 		 947 aa  162  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1090 aa  158  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  22.01 
 
 		 1132 aa  144  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  22.88 
 
 		 1132 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 		 1110 aa  137  8e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  21.66 
 
 		 868 aa  134  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  22.26 
 
 		 1016 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  21.52 
 
 		 859 aa  125  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  22.79 
 
 		 743 aa  125  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  19.2 
 
 		 773 aa  122  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  25.56 
 
 		 1177 aa  118  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  22.55 
 
 		 759 aa  113  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  19.75 
 
 		 1068 aa  110  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  22.66 
 
 		 1143 aa  108  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  24.3 
 
 		 1232 aa  95.9  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.82 
 
 		 737 aa  95.1  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  20.33 
 
 		 876 aa  94  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  23.04 
 
 		 917 aa  87.8  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  20.84 
 
 		 749 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  26.49 
 
 		 838 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.52 
 
 		 1211 aa  64.7  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.31 
 
 		 386 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2537  hypothetical protein  21.52 
 
 		 793 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.22202  hitchhiker  0.0000000191831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  23.29 
 
 		 876 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  21.37 
 
 		 828 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  21.86 
 
 		 821 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.09 
 
 		 414 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  22.09 
 
 		 414 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  26.88 
 
 		 845 aa  54.7  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  24.25 
 
 		 806 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  21.86 
 
 		 829 aa  52.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.31 
 
 		 930 aa  51.6  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 856 aa  51.6  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1961  protein of unknown function DUF214  25.16 
 
 		 845 aa  50.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.61 
 
 		 855 aa  50.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  22.87 
 
 		 413 aa  50.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  20.7 
 
 		 811 aa  50.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  23.71 
 
 		 863 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  21.82 
 
 		 843 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  22.52 
 
 		 416 aa  50.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  24.39 
 
 		 873 aa  50.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  22.87 
 
 		 422 aa  49.3  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  25.91 
 
 		 834 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25 
 
 		 836 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 		 855 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 		 791 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2317  hypothetical protein  25.52 
 
 		 947 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  37.23 
 
 		 841 aa  48.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2903  hypothetical protein  27.55 
 
 		 410 aa  48.1  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  31.08 
 
 		 848 aa  47.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3859  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.78 
 
 		 416 aa  47.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.71 
 
 		 417 aa  47.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0081  hypothetical protein  36.7 
 
 		 420 aa  47.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.466459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.77 
 
 		 415 aa  47.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25430  hypothetical protein  27.71 
 
 		 416 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2173  hypothetical protein  27.71 
 
 		 416 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>