201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0969 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  100 
 
 		 806 aa  1545    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  48.04 
 
 		 876 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  27.44 
 
 		 787 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  26.39 
 
 		 789 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  23.22 
 
 		 791 aa  128  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  27.57 
 
 		 788 aa  127  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 		 789 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 		 789 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  25 
 
 		 787 aa  122  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  26.49 
 
 		 788 aa  114  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  24.03 
 
 		 789 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  21.47 
 
 		 788 aa  110  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  21.65 
 
 		 792 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  26.11 
 
 		 787 aa  108  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  23.21 
 
 		 1132 aa  107  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  23.25 
 
 		 1132 aa  105  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  25.65 
 
 		 793 aa  104  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  23.76 
 
 		 787 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 		 792 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  25.69 
 
 		 787 aa  99.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  25.62 
 
 		 787 aa  99  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  21.95 
 
 		 792 aa  99  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  24.89 
 
 		 787 aa  98.2  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  25.15 
 
 		 788 aa  97.8  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  24.65 
 
 		 787 aa  96.3  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  21.61 
 
 		 797 aa  94.4  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  26.78 
 
 		 790 aa  92  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  26.16 
 
 		 793 aa  90.5  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  22.9 
 
 		 800 aa  89.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  27.86 
 
 		 786 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  19.24 
 
 		 947 aa  88.6  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  21.73 
 
 		 876 aa  88.6  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  26.66 
 
 		 790 aa  88.2  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  21.7 
 
 		 868 aa  85.5  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  22.53 
 
 		 787 aa  85.5  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  26.87 
 
 		 789 aa  84  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 		 786 aa  83.2  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  22.94 
 
 		 787 aa  82  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 		 788 aa  82  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  24.91 
 
 		 789 aa  81.3  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  23.05 
 
 		 1143 aa  80.5  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  26.77 
 
 		 787 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  25.4 
 
 		 791 aa  79  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 		 787 aa  79.3  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  24.64 
 
 		 787 aa  78.6  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  25.35 
 
 		 1177 aa  75.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  28.82 
 
 		 786 aa  75.5  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  30.2 
 
 		 806 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  22.87 
 
 		 1016 aa  71.2  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  27.02 
 
 		 786 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  22.85 
 
 		 787 aa  68.6  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  25.41 
 
 		 793 aa  68.9  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  24.46 
 
 		 1232 aa  68.6  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  21.94 
 
 		 774 aa  65.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  19.6 
 
 		 1090 aa  65.1  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  21.73 
 
 		 833 aa  64.3  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  22.14 
 
 		 787 aa  64.3  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  23.41 
 
 		 1110 aa  60.5  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  27.68 
 
 		 836 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  18.96 
 
 		 859 aa  58.2  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  25.63 
 
 		 786 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 		 796 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  28.03 
 
 		 845 aa  56.2  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2748  putative lipoprotein releasing system transmembrane  28.5 
 
 		 418 aa  55.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 		 443 aa  55.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.52 
 
 		 408 aa  54.7  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  30.52 
 
 		 413 aa  54.7  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 		 852 aa  54.7  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  23.51 
 
 		 393 aa  54.3  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  29.41 
 
 		 416 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  28.24 
 
 		 416 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1765  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.91 
 
 		 413 aa  53.5  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157209  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.91 
 
 		 417 aa  53.9  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.16 
 
 		 423 aa  53.9  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27.59 
 
 		 825 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1541  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.96 
 
 		 413 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.470748  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.75 
 
 		 427 aa  53.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 406 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2154  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.24 
 
 		 416 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0219351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  25.6 
 
 		 643 aa  52.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.17 
 
 		 415 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 		 859 aa  52.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3588  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.24 
 
 		 416 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  24.15 
 
 		 386 aa  52.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  26.11 
 
 		 400 aa  52  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  24.8 
 
 		 848 aa  51.6  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  24.88 
 
 		 402 aa  51.6  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25.93 
 
 		 843 aa  51.2  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1695  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.65 
 
 		 416 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  32.95 
 
 		 857 aa  50.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.76 
 
 		 419 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  27.63 
 
 		 715 aa  50.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.88 
 
 		 811 aa  49.7  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  24.32 
 
 		 389 aa  50.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  31.43 
 
 		 411 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1671  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.65 
 
 		 416 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.966628  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.93 
 
 		 424 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  26.97 
 
 		 404 aa  49.7  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.19 
 
 		 386 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25 
 
 		 439 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.14096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>