71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1055 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
787 aa  1572    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  63.31 
 
 
787 aa  976    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  41.95 
 
 
787 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  42.69 
 
 
787 aa  611  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  41.42 
 
 
787 aa  572  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  38.2 
 
 
787 aa  551  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  39.14 
 
 
787 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  40.98 
 
 
793 aa  539  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  41.04 
 
 
787 aa  534  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  39.1 
 
 
788 aa  528  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  41.22 
 
 
787 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  40.18 
 
 
786 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  37.74 
 
 
787 aa  522  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  37.44 
 
 
789 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  37.44 
 
 
789 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  37.87 
 
 
789 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  40.79 
 
 
789 aa  515  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  37.23 
 
 
787 aa  515  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  38.12 
 
 
787 aa  512  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  38.37 
 
 
791 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  39.2 
 
 
789 aa  502  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  33.63 
 
 
788 aa  488  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  38.35 
 
 
790 aa  472  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  40.15 
 
 
786 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  36.5 
 
 
787 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  37.52 
 
 
788 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  41.02 
 
 
786 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  39.26 
 
 
786 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  39.39 
 
 
786 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  35.79 
 
 
788 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  36.84 
 
 
793 aa  458  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  36.21 
 
 
787 aa  449  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  37.42 
 
 
788 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  37.76 
 
 
789 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  35.8 
 
 
793 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  33.5 
 
 
800 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  37.07 
 
 
790 aa  412  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  27.64 
 
 
791 aa  314  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  27.55 
 
 
792 aa  301  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  28.73 
 
 
792 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  29.9 
 
 
792 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  26.12 
 
 
797 aa  262  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  27.69 
 
 
787 aa  241  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  25.92 
 
 
947 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  24.14 
 
 
774 aa  160  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  25.63 
 
 
1090 aa  157  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  24.26 
 
 
1132 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  23.21 
 
 
1132 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  23.36 
 
 
859 aa  131  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 
1016 aa  125  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  24.79 
 
 
1110 aa  114  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  23.38 
 
 
868 aa  111  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  19.16 
 
 
773 aa  110  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  20.79 
 
 
1068 aa  105  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  24.29 
 
 
917 aa  104  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  24.83 
 
 
1177 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  21.67 
 
 
1143 aa  101  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  24.44 
 
 
1232 aa  91.7  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  22.06 
 
 
876 aa  91.3  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.68 
 
 
1211 aa  86.3  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.11 
 
 
737 aa  79.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 
759 aa  79  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  18.74 
 
 
743 aa  75.5  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  26.42 
 
 
806 aa  58.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.71 
 
 
386 aa  54.3  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  24.5 
 
 
836 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  25.11 
 
 
839 aa  49.3  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 
416 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
846 aa  44.3  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  23.74 
 
 
850 aa  44.3  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  24.85 
 
 
856 aa  44.3  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>