133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0077 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  48.79 
 
 		 787 aa  766    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  43.07 
 
 		 787 aa  641    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  100 
 
 		 787 aa  1560    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  44.09 
 
 		 787 aa  639    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  44.73 
 
 		 787 aa  630  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  41.4 
 
 		 787 aa  601  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  42.31 
 
 		 787 aa  589  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  40.28 
 
 		 787 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  42.26 
 
 		 789 aa  579  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  42.46 
 
 		 790 aa  569  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  40.03 
 
 		 787 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  39.77 
 
 		 787 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  38.69 
 
 		 788 aa  561  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  39.85 
 
 		 793 aa  562  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  39.26 
 
 		 787 aa  559  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  38.75 
 
 		 789 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  40.65 
 
 		 788 aa  550  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  40.43 
 
 		 786 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  39.87 
 
 		 789 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  39.87 
 
 		 789 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  41.22 
 
 		 787 aa  537  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  41.8 
 
 		 787 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  39.42 
 
 		 787 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  41.25 
 
 		 793 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  38.17 
 
 		 791 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  39.65 
 
 		 800 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  39.8 
 
 		 788 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  41.67 
 
 		 788 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  39.65 
 
 		 786 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  39.9 
 
 		 786 aa  512  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  39.02 
 
 		 786 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  40.43 
 
 		 786 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  38 
 
 		 789 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  37.95 
 
 		 788 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  39.16 
 
 		 789 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  38.45 
 
 		 793 aa  479  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  39.22 
 
 		 790 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  31.38 
 
 		 792 aa  343  7e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  30.24 
 
 		 792 aa  301  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  28.89 
 
 		 791 aa  299  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  25.53 
 
 		 792 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  27.34 
 
 		 797 aa  273  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  27.28 
 
 		 787 aa  241  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  25.31 
 
 		 947 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  24.06 
 
 		 1132 aa  138  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  24.24 
 
 		 1132 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  22.06 
 
 		 774 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  25.32 
 
 		 859 aa  120  9e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1090 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  22.41 
 
 		 773 aa  117  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 		 1016 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  23.71 
 
 		 868 aa  111  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 		 1110 aa  106  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 		 1177 aa  99  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  23.79 
 
 		 1143 aa  96.7  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  18.93 
 
 		 743 aa  89  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  19.82 
 
 		 1068 aa  87  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.34 
 
 		 737 aa  86.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  22.7 
 
 		 876 aa  85.9  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  21.48 
 
 		 759 aa  82.4  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  25 
 
 		 1232 aa  81.6  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  23.13 
 
 		 917 aa  71.2  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  25.8 
 
 		 854 aa  62.4  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25.45 
 
 		 843 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 848 aa  58.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  29.79 
 
 		 930 aa  57.4  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  22.32 
 
 		 806 aa  57  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 		 897 aa  55.1  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  28.16 
 
 		 855 aa  54.7  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.56 
 
 		 807 aa  54.7  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  35.63 
 
 		 841 aa  54.3  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  22.35 
 
 		 876 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  21.25 
 
 		 749 aa  53.9  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  23.67 
 
 		 838 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1547  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.89 
 
 		 417 aa  52  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  25.23 
 
 		 384 aa  52  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  23.82 
 
 		 389 aa  51.6  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.3 
 
 		 836 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 391 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  25.23 
 
 		 391 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  22.32 
 
 		 414 aa  51.2  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  33.33 
 
 		 880 aa  51.2  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  25.23 
 
 		 391 aa  50.8  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  25.23 
 
 		 391 aa  50.8  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  25.23 
 
 		 391 aa  50.8  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  23.51 
 
 		 845 aa  51.2  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.59 
 
 		 427 aa  51.2  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  25.23 
 
 		 383 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  25.23 
 
 		 383 aa  50.8  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  25.23 
 
 		 391 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  23.74 
 
 		 859 aa  50.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  23.8 
 
 		 416 aa  50.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  25.23 
 
 		 383 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  22.99 
 
 		 834 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0018  hypothetical protein  36 
 
 		 1797 aa  49.3  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  24.09 
 
 		 414 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 		 404 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.3 
 
 		 855 aa  48.5  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.27 
 
 		 414 aa  48.1  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3649  protein of unknown function DUF214  21.97 
 
 		 839 aa  48.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.652246 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>