Gene MCAP_0018 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagMCAP_0018 
Symbol 
ID3828921 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameMycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_007633 
Strand
Start bp16712 
End bp22105 
Gene Length5394 bp 
Protein Length1797 aa 
Translation table
GC content24% 
IMG OID637823187 
Producthypothetical protein 
Protein accessionYP_424016 
Protein GI83319828 
COG category[M] Cell wall/membrane/envelope biogenesis 
COG ID[COG4591] ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component 
TIGRFAM ID[TIGR01435] glutamate--cysteine ligase/gamma-glutamylcysteine synthetase, Streptococcus agalactiae type 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
ATGAAAAATT TATATTTAAT GCTAAAACAG GGAGTAAAAT GAATTTTAAA ATTCAAGCTT 
CAACTAGTTG TTATTGTAGT TTTGACTTTT ATTGCTTCAA GTATTTTAAC AATTTCTTTT
ACCACTAATA AAAGATTAAG TTCAGCTTAT AATCAAGTTG TTAATAACCA AAACTCCCCT
AAATTCGATT CAACTTATCA AATAACAGTT GGAAGTAAAG CTAGACCTAA AAAAGGTGAA
CCTTTATTTA TTCCTATTTT TGATTTTGTA AATAAACAAT ATACTGGATT TAAAGATGAG
GGTTATGATA ATTTTAATCT AACTTTTAAT GATATTTATG GTGAAAAAAA CCTTTTAACA
ATTGCAACAA GTTCAAAGGA ATTTAAAGAT GCTTGAGCAA GAAAAAAAGA TATTTTTATA
TATGAAGACA ATGATGATGA TAAAAAGCAA ATAGCAAACC AACAACAAGA TTTTGACTTT
GTTATAAATG ATGCGTTTTT TAATACAATG GTTGATTTAC TTTCAAAAAA TGATCCAGCT
ATTAAAAATA CTGTAATTGG TAGATATACT CAATCTAATC CAAATTGATA TAAACATTTC
TATAATAAAG AAAAAAATAT TAAAAGTAAC TGATCTGATT TTATTAAAAA TAAAACTAAA
ATTCAAAATT TAAAAAATAC TAATCCAGAT GATTTAAAGA CTTACTTTTA CTCATATTAT
GCTTTTGAAT CACTTTCTCA ATATTTCTTT AAGACTATTC AAACATTTTT ACAAGATAGC
AAAAATGAGC TAAGTCAGCA AACTTTTGCA CACCAAGAAG AAGCATATAA ATATTTTTAT
GAATTTTTAT TTGGTAAATA TTTTGATGAA AACAATAAAA AGGCAAGTTA TAAAGATGAA
TATATCGCAA CTAATGATAA CCTTTATACT TTAACTTTTG ATTCAAGTGT ACCTACTAGT
GAATTTCAAA AAATGAAATT CTTAATTAAA TTAGAAAATA AAGATGATAA ACAACAAGAA
CAAGATTTCT TTACTCAATT AGTTAAACAA GGTTTTAAAG GTATTTTAAG ACCACTTCAA
ATTACTTATC ATAATACTGG TAATGAAACT GATATTACTA ATGTAATTCA ATATAGTGAA
ACTCAAGAAT TAAGAGGTTT TGTTTCAAAT TCAAATACTT ATTCTCAAGA TGTAAAAGAA
TTACCTGAAA TATTTAAAAA TAATAGTTTT GTAGATATAT TAGCTATGAA TGCTGATCCA
TTTGCTAATA TTGGTGAAAA ATCTATTAAT TTTTATACTA GTAAAACAAA TGATCTTGAA
ACTACAGTTG CTTCAGATTT TCCAATTACA GCTGCATTTT TAACTCATCA TAAACTATCT
GCTTTAGCTA ATGGTTATGA TTTATACATT AGACCTGAAA CTATATTTAA TGATCCAATC
ACTAAAAAGA CATTTAGAAT TGTTGATATA AGTAATAAAA ATTATACTAA CTACATAATT
TTAAATGGAC ACGCTCCAAG TAGTGCTAGT GAAATAACAA TAAGTAAACA ATTTGCAAAA
GCTAATAAAA TTCGAATCTG TGATCGTTTA ACTTTAGGTA ATGCTAAAGG TTTAATTGTT
ACAGGTTATG CTGTTGATAC TTATTCATTT TTTCCAACTT CAGATCCAAA TGTTCCCTTA
CCAAAATCTG ATTCTGGAGG TTTAATTTAT GCTGACTTTA CAACTATTAA TCAAATTTTA
GGTGATGGAA ATTCAGCAAC AGGAAATGAT CAAACTTCTA CATTTAATTT CTTTTTAATT
AAAAACAATA ATTCTTTAAA TATTAAAAAT GTATATTTTG ATCATTTTTC AGTAGCAGAT
AAAATTAGAG ATAACATTAT AGCTAAGCAA AAAGGAACTG AAATTCAGAC ATTTTATAAA
AATCAACAAT TTAGTGATTC TTCATATTCT TTAAATTGAA CTTTATATCA AAGAGTTGCA
TTTTGATATT CACTAGCAAC ATTTCTAACA GCTAGTTTAA TTGCTCTTGT TTCAGCATTA
GCTGTATTTG TTGGAGTTAT TAAATCAATT CAAGCAAACT CAAAGCAAAT TGGTATTTTA
AAAGCAAATG GAGCTTCAAG CAGTACTATT TCATGATCAT ATGTTTCATA TGCTGTGATT
CTAGTTTTTA TAGCAATACC TTTAGGTTGA ATGGCTGGTA CAATGTTACA AGTCCCATTT
GTTGCTATTT TTAAAGATTA TTTTAGTTTT AAAACAAATG TACTGACTTA TGATTGATTA
GCACCGTTAA TATCTATTAT TATTTTTGGA GTTTTAATTG GAGTATTTTC ATTTTTGGTT
GCTTTATTTC ATATTAAAAA ACCAGTATTA GATATTATAA AAAGTTCTAA GAAATGATCT
AAACCAAAAA TTACAGATTG ATTACATAAA CGTATTTTTA AAAAACCTAG ATTTACTACT
TTATTAATGC TAAAACTAAC TGAATCTGGT AAAAAACCTT TTAGTTTGTT ATTAGTATTA
GTGTTTGTAG GAACTTTATT TGTTTCAGCT GGTATAGCTA TTCCTAGTGT TACTAAATAT
GCTAAAGATA ATTACTTTAA AAAAGTTAAT TATAATAATC AGTATGAAAT TTATAATAGT
TTATCAAATA GCCCATTAGG AAAAGATGTA TTTAATTTTT GAAATGGTCA TGAACAAATT
GATAATACTT ATAAAGAAAT TAAAGACTCT AGTGGAACTA TTAATTATTA TGAAGATCCA
AATAGTTATA CTTTATCAAA TCAAAACTCT TCAGTTTTAC CTCAACTAAT TTATAAAATT
AGTACTAAAG ATAATAATTC TAATATAAAT AGTGCTGAAA TACTGACTCC ATATAAATCA
ATTATTAAAG AATATTTAAA AACTGGAGTT TCTGATTTAT ATAAAAACTT ATTAGATTGA
GCTTCATATC TAATTAGTAT TTCAAATGGT AAAAGTATTT CAATTGGAAC AATAGAACAA
CTTTATGCTT ATGTTTTAAA TGATGCTGAT TTAAATGAGC GCTTTAAAAA TGACATAGAT
AAAGTTAGAG AAACTAATAA TGTTACTCAA CCTTTAACTC AATTTGTTGG AGAACTTTTA
AAGACTATTT TTAAAGAAAA AATTCAAAAT ACAGGTGAAT GAAAAGAAAA AATTTTAAAT
TTAATTTTAG GCTATTCTCC TTCATTTATT AAATCTTATT TAACAAGTGA ATCTAGAAAA
AATCAGCTTT CTTTTGGTTG ACAAAAACAA ACTATAATTC CACAAAAAGA TCAACTAGCA
ACTATTTTTA AACCTAAATC AAATAATATT GAAGCTGATT ATAGTATTTT AGGACTAGAT
AAAAATCAAC AAACTTATAA ACTAGATGAT AAGCAAAAAA ATCAGCTATT TTTATCAAAT
AATAATGTTC AAAAACTTTA TAAAATTATT AATTCTCCAT ATGATAAAAA TCAAAATAAT
GATGTTTATT TAAATAATTT TAAAGTTTAT GATCATAAAA CTAATACTTT AACAATACCA
ACTATTGTTA ATAAAAACTT AAATTATAAA TTGAATAAAT ATGGAGATAG TATTATTTCT
AATCTATCAA CTAATAATGT TCAACTATCT TATAAAACAA GAAATGGTGA TTTTAATGTT
TTACCAAAAC AAGCTTGAAT ATATGATGAT TCAGATTATC TAAAAACTAA GTATGTAAAT
AAGCATGCTA AGTGAGAAGA ACAACCAATT CAATTTATTA ATACTAAAGA TAATTATTCT
TCTTATGGGT ATGAAGTAGT TGAAAATAAT ACAGAAAAAT ATTATTATTT AAATCCTTAT
AATTTAGATG TTAATAAATT TACTCAAAGA CAAGTTATTG ATATTTGATC TAAAGATTCA
AATAATCAGA TAATAGCTAA ACAACATGAA GACATTGTTG ATGAATCTCC TTTATTTGGT
GATTTTGTAA TTAATAACGA TGCACAAATC ATCAAGTCAT TTATTAGACC TTATTATCAA
TTAAGAAACT TATTATTATT TATTCCAATA ACTAATGAAG TTAGTTGAGA AGATTTTGCA
TTATATGCAA GTGGTTGAAA TAAATCTAGT GAACATAATC TTGATTTAAA AACTATAATT
TCTGATTTAG ATAAAAATGA TGATCATACT AGAAATTATA AATACCCAGC TATTAGAAAA
CTTGAAGCTG ATTTAGTTCC TAATTCAGTT AAAAATGCTT GAAAATCAGC AATTAGTACT
ATTGACAATA ATACTAAATA TTTAGCTATT AGACCTTATG ATTTTTCTAT TCAACAAGAA
AAATGATCTA ATAATTACTA TGAATATTTC ATTTTAAATG ATAAAAAACA AATTATTGGT
GTTAATCCAC ACTCAGCTGA TAAGGCTATT CCTAACTTGT TATTAAATTC AGTTCCACAT
TTTTATAGAA GAGCTGTTGG GAAAAGAAAA AATGTTCCAG CTATTATCCA ATTACATAAT
AAAAATGTTA GTTATGTAAA TAAAGATTTA AAAATTAAAC TACAAAAAGT TGATGATATT
GATATTTATG GAAAAGCTTA TGCTTTAGTT GATTCTGATT TAGCTAATAT GTTATATGGA
TTTGATATTA GTAGATCAAC TAACTATAAT TACAAGCCAT TTGATACTTC TAAAATCATT
AAAAAAGGTG AATTATTTAA TACTTATAAA ACTACAAATT GATTAAAAGT AAATAATAAA
GATCCTTGAA AGCAAGCTTT TATTAGCCAA AAAGATACAT TTAGTTATTC ACCACATTAC
TATTACAATA CAATCTTTTC AAATTCTAGT GAACCTTTAA TTATTACTAG TTCAGTTTCA
TTAATTTCAG AACAAAGATT AGGTATTGCA ATTTTAGATC TAATGAACTT AAGTGATTAT
AAAGCGGGTA TAGTTGATGT TGATTTTACC TTTGAAACTA AACAGTTATT AAATCAAATA
GCTAAAACCG CTATTTATAT AGCAATAATT ATAATTACAG CAATTATGTT ATGTGCTTCA
TTATTAATTA TGCTAATAAC TGATATTTAT ATTTCTCAAT ATAAATCATT TATGATAATG
TTAAGATCAA TGGGTTATAC AAATACTCAA GTAATGTTTT ACACACTTGG AGTAGCTACT
ATATTTAGTT TATTAATTTC ATTTATTACA ACAATTATTG TATTTAGTAG TACAACAATA
ATTGATAAGG CGTTTTCAGC AAATGGATTT TCAATTCCAA TTAATGTTTA TTGAATATCA
GTAGTATTTT GTATTTTACT AATTCTAGTA TCTTTCTTTA GTTCTTTATG AGTTTCAACA
AAAAGAGTAA GAAATGCTGA ACCAAGCACA ATGCTAAGTG AAGTTGATGA CTAA
 
Protein sequence
MKNLYLMLKQ GVKWILKFKL QLVVIVVLTF IASSILTISF TTNKRLSSAY NQVVNNQNSP 
KFDSTYQITV GSKARPKKGE PLFIPIFDFV NKQYTGFKDE GYDNFNLTFN DIYGEKNLLT
IATSSKEFKD AWARKKDIFI YEDNDDDKKQ IANQQQDFDF VINDAFFNTM VDLLSKNDPA
IKNTVIGRYT QSNPNWYKHF YNKEKNIKSN WSDFIKNKTK IQNLKNTNPD DLKTYFYSYY
AFESLSQYFF KTIQTFLQDS KNELSQQTFA HQEEAYKYFY EFLFGKYFDE NNKKASYKDE
YIATNDNLYT LTFDSSVPTS EFQKMKFLIK LENKDDKQQE QDFFTQLVKQ GFKGILRPLQ
ITYHNTGNET DITNVIQYSE TQELRGFVSN SNTYSQDVKE LPEIFKNNSF VDILAMNADP
FANIGEKSIN FYTSKTNDLE TTVASDFPIT AAFLTHHKLS ALANGYDLYI RPETIFNDPI
TKKTFRIVDI SNKNYTNYII LNGHAPSSAS EITISKQFAK ANKIRICDRL TLGNAKGLIV
TGYAVDTYSF FPTSDPNVPL PKSDSGGLIY ADFTTINQIL GDGNSATGND QTSTFNFFLI
KNNNSLNIKN VYFDHFSVAD KIRDNIIAKQ KGTEIQTFYK NQQFSDSSYS LNWTLYQRVA
FWYSLATFLT ASLIALVSAL AVFVGVIKSI QANSKQIGIL KANGASSSTI SWSYVSYAVI
LVFIAIPLGW MAGTMLQVPF VAIFKDYFSF KTNVLTYDWL APLISIIIFG VLIGVFSFLV
ALFHIKKPVL DIIKSSKKWS KPKITDWLHK RIFKKPRFTT LLMLKLTESG KKPFSLLLVL
VFVGTLFVSA GIAIPSVTKY AKDNYFKKVN YNNQYEIYNS LSNSPLGKDV FNFWNGHEQI
DNTYKEIKDS SGTINYYEDP NSYTLSNQNS SVLPQLIYKI STKDNNSNIN SAEILTPYKS
IIKEYLKTGV SDLYKNLLDW ASYLISISNG KSISIGTIEQ LYAYVLNDAD LNERFKNDID
KVRETNNVTQ PLTQFVGELL KTIFKEKIQN TGEWKEKILN LILGYSPSFI KSYLTSESRK
NQLSFGWQKQ TIIPQKDQLA TIFKPKSNNI EADYSILGLD KNQQTYKLDD KQKNQLFLSN
NNVQKLYKII NSPYDKNQNN DVYLNNFKVY DHKTNTLTIP TIVNKNLNYK LNKYGDSIIS
NLSTNNVQLS YKTRNGDFNV LPKQAWIYDD SDYLKTKYVN KHAKWEEQPI QFINTKDNYS
SYGYEVVENN TEKYYYLNPY NLDVNKFTQR QVIDIWSKDS NNQIIAKQHE DIVDESPLFG
DFVINNDAQI IKSFIRPYYQ LRNLLLFIPI TNEVSWEDFA LYASGWNKSS EHNLDLKTII
SDLDKNDDHT RNYKYPAIRK LEADLVPNSV KNAWKSAIST IDNNTKYLAI RPYDFSIQQE
KWSNNYYEYF ILNDKKQIIG VNPHSADKAI PNLLLNSVPH FYRRAVGKRK NVPAIIQLHN
KNVSYVNKDL KIKLQKVDDI DIYGKAYALV DSDLANMLYG FDISRSTNYN YKPFDTSKII
KKGELFNTYK TTNWLKVNNK DPWKQAFISQ KDTFSYSPHY YYNTIFSNSS EPLIITSSVS
LISEQRLGIA ILDLMNLSDY KAGIVDVDFT FETKQLLNQI AKTAIYIAII IITAIMLCAS
LLIMLITDIY ISQYKSFMIM LRSMGYTNTQ VMFYTLGVAT IFSLLISFIT TIIVFSSTTI
IDKAFSANGF SIPINVYWIS VVFCILLILV SFFSSLWVST KRVRNAEPST MLSEVDD