93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3584 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  100 
 
 
787 aa  1543    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  42.82 
 
 
787 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  41.8 
 
 
787 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  40.53 
 
 
787 aa  554  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  42.53 
 
 
787 aa  550  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  41.73 
 
 
789 aa  538  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  41.8 
 
 
787 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  38.37 
 
 
787 aa  523  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  40.38 
 
 
787 aa  525  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  40.38 
 
 
793 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  38.25 
 
 
787 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  37.87 
 
 
789 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  39.09 
 
 
787 aa  498  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  36.9 
 
 
789 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  36.9 
 
 
789 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  38.71 
 
 
788 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  37.87 
 
 
787 aa  488  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  37.36 
 
 
787 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  39.11 
 
 
791 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  39.1 
 
 
789 aa  485  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  37.77 
 
 
788 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  40.2 
 
 
788 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  38.86 
 
 
786 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  33.5 
 
 
788 aa  473  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  37.64 
 
 
787 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  40.99 
 
 
786 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  41.24 
 
 
786 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  38.01 
 
 
790 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  41.12 
 
 
786 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  38.52 
 
 
789 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  36.21 
 
 
787 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  38.9 
 
 
793 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  37.5 
 
 
788 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  37.69 
 
 
793 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  36.35 
 
 
800 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  40.96 
 
 
786 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  37.74 
 
 
790 aa  398  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 
792 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  30.49 
 
 
791 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 
792 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  29.64 
 
 
792 aa  296  9e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  25.43 
 
 
797 aa  273  7e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  30.9 
 
 
787 aa  253  8.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
774 aa  154  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  23.63 
 
 
1132 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  22.83 
 
 
1132 aa  138  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  22.94 
 
 
947 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  27.55 
 
 
1177 aa  121  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  23.31 
 
 
1090 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  22.29 
 
 
876 aa  114  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  21.58 
 
 
1143 aa  112  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  21.48 
 
 
859 aa  108  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  21.03 
 
 
773 aa  107  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  21.73 
 
 
1016 aa  106  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  21.86 
 
 
868 aa  104  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  24.55 
 
 
1232 aa  100  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  24.96 
 
 
1110 aa  99  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  19.42 
 
 
1068 aa  96.7  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  22.39 
 
 
737 aa  95.1  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  21.26 
 
 
743 aa  84.7  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  22.7 
 
 
917 aa  84  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  20.65 
 
 
749 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  21.83 
 
 
759 aa  80.5  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.89 
 
 
1211 aa  74.7  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  24.84 
 
 
806 aa  62.4  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  27.56 
 
 
847 aa  59.3  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.2 
 
 
870 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 
847 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  24.51 
 
 
414 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  23.83 
 
 
362 aa  53.9  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  25.62 
 
 
876 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 
878 aa  50.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  24.06 
 
 
866 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.86 
 
 
852 aa  48.9  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 
840 aa  48.9  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  27.12 
 
 
850 aa  48.9  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  24.69 
 
 
846 aa  48.5  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.93 
 
 
811 aa  47.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 
834 aa  47.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2228  ABC transporter, permease  22.37 
 
 
779 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.622849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1839  protein of unknown function DUF214  25.54 
 
 
416 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  0.633197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  28.91 
 
 
849 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2274  ABC transporter, permease  21.33 
 
 
779 aa  46.6  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000117587  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  29.01 
 
 
393 aa  46.6  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2502  ABC transporter, permease protein  21.33 
 
 
735 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2481  ABC transporter permease  21.33 
 
 
779 aa  45.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00745912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.11 
 
 
849 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2306  ABC transporter permease  21.33 
 
 
779 aa  45.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  26.57 
 
 
379 aa  44.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  25 
 
 
411 aa  44.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  26.06 
 
 
397 aa  44.7  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2577  ABC transporter, permease protein  21.74 
 
 
779 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000406057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 
849 aa  43.9  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>