126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1478 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  57.87 
 
 		 793 aa  855    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  68.49 
 
 		 787 aa  1050    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  43.46 
 
 		 787 aa  659    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  44.6 
 
 		 789 aa  678    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  42.19 
 
 		 789 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  70.06 
 
 		 788 aa  1090    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 787 aa  1580    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  77.89 
 
 		 787 aa  1234    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  69.25 
 
 		 787 aa  1128    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  46.26 
 
 		 787 aa  672    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  42.19 
 
 		 789 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  43.73 
 
 		 787 aa  634  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  44.51 
 
 		 793 aa  625  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  44.01 
 
 		 789 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  44.09 
 
 		 789 aa  612  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  43.08 
 
 		 788 aa  595  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  40.91 
 
 		 787 aa  583  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  37.24 
 
 		 788 aa  573  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  40.66 
 
 		 786 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  41.01 
 
 		 787 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  38.96 
 
 		 787 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  41.88 
 
 		 790 aa  547  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  40 
 
 		 791 aa  542  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  40.03 
 
 		 787 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  38.9 
 
 		 788 aa  525  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  39.14 
 
 		 787 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  39.02 
 
 		 800 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  39.9 
 
 		 786 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  39.08 
 
 		 793 aa  515  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  40.89 
 
 		 786 aa  512  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  40.51 
 
 		 786 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  37.66 
 
 		 787 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  40.35 
 
 		 786 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  38.94 
 
 		 788 aa  482  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  38.26 
 
 		 787 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  38.41 
 
 		 790 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  36.61 
 
 		 789 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  33.42 
 
 		 792 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  30.59 
 
 		 791 aa  343  5.999999999999999e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  29.25 
 
 		 792 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  29.16 
 
 		 792 aa  308  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  28.62 
 
 		 797 aa  304  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  29.06 
 
 		 787 aa  300  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  24.24 
 
 		 774 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  25.09 
 
 		 1132 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  24.86 
 
 		 1132 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  24.11 
 
 		 947 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  24.42 
 
 		 859 aa  131  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  22.62 
 
 		 868 aa  130  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  22.67 
 
 		 773 aa  124  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 		 1143 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1090 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  22.49 
 
 		 1016 aa  110  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  21.71 
 
 		 743 aa  107  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  23.09 
 
 		 737 aa  103  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  21.68 
 
 		 1068 aa  95.9  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  23.62 
 
 		 876 aa  93.2  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  23.39 
 
 		 1177 aa  92.8  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  22.82 
 
 		 1110 aa  92.8  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  23.34 
 
 		 917 aa  92  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  21.58 
 
 		 759 aa  89  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  22.6 
 
 		 1232 aa  75.5  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.59 
 
 		 1211 aa  65.9  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  26.05 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  24.52 
 
 		 806 aa  61.6  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  23.82 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.16 
 
 		 371 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf117  ABC transporter permease protein  23.14 
 
 		 2777 aa  55.5  0.000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.247181  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  23.28 
 
 		 759 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  21.85 
 
 		 811 aa  54.7  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  20.07 
 
 		 749 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  21.75 
 
 		 389 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  25.38 
 
 		 878 aa  52  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  26.72 
 
 		 404 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2306  ABC transporter permease  23.87 
 
 		 779 aa  50.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2274  ABC transporter, permease  23.87 
 
 		 779 aa  50.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000117587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2481  ABC transporter permease  23.87 
 
 		 779 aa  50.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00745912  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  24.19 
 
 		 414 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2502  ABC transporter, permease protein  23.87 
 
 		 735 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  26.77 
 
 		 930 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  26.54 
 
 		 876 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  23.78 
 
 		 452 aa  48.5  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  22.99 
 
 		 443 aa  48.5  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  20.32 
 
 		 856 aa  48.1  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  24.8 
 
 		 863 aa  48.5  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  31.75 
 
 		 849 aa  48.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 		 838 aa  48.5  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  22.96 
 
 		 847 aa  48.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2512  ABC transporter, permease protein  23.19 
 
 		 775 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00525405  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  24.58 
 
 		 429 aa  48.1  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2228  ABC transporter, permease  20.31 
 
 		 779 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.622849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  25.6 
 
 		 414 aa  47.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2577  ABC transporter, permease protein  23.38 
 
 		 779 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000406057  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 831 aa  47.8  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 		 429 aa  47.8  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.26 
 
 		 416 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.36 
 
 		 415 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  25.43 
 
 		 389 aa  47  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  22.32 
 
 		 848 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  25.88 
 
 		 395 aa  47  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>