37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01820 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  100 
 
 		 811 aa  1663    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.97 
 
 		 737 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 		 749 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  20.69 
 
 		 743 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03260  predicted membrane protein  29.91 
 
 		 961 aa  109  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.484426 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  19.32 
 
 		 797 aa  83.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  25.37 
 
 		 787 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  21.21 
 
 		 792 aa  71.6  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  19.91 
 
 		 1132 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  19.75 
 
 		 1132 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0792  hypothetical protein  26.02 
 
 		 714 aa  65.1  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  18.58 
 
 		 859 aa  63.5  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  22.78 
 
 		 1016 aa  61.6  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  20.69 
 
 		 773 aa  60.8  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  22.03 
 
 		 791 aa  59.7  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  20.03 
 
 		 947 aa  60.1  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl156  unknown substrate ABC transporter permease  22.66 
 
 		 1429 aa  58.2  0.0000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  22.65 
 
 		 787 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  22.09 
 
 		 787 aa  55.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  21.64 
 
 		 787 aa  54.7  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  20.87 
 
 		 787 aa  54.7  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  19.34 
 
 		 774 aa  54.7  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  20.54 
 
 		 1143 aa  54.3  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  37.11 
 
 		 852 aa  51.2  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1090 aa  48.9  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  27.91 
 
 		 1211 aa  47.8  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  21.27 
 
 		 788 aa  47.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000166  predicted ABC-type transport system permease component  25.35 
 
 		 818 aa  47.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0664  hypothetical protein  36.07 
 
 		 1381 aa  47.4  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.315875  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1840  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.59 
 
 		 433 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  21.67 
 
 		 787 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  22.31 
 
 		 787 aa  45.8  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  36.9 
 
 		 787 aa  45.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  20.82 
 
 		 876 aa  45.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05800  hypothetical protein  24.93 
 
 		 818 aa  44.3  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  20.84 
 
 		 787 aa  44.3  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>