80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03260 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_03260  predicted membrane protein  100 
 
 
961 aa  1954    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.484426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 
749 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  22.33 
 
 
743 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  20.76 
 
 
1016 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.2 
 
 
811 aa  102  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.46 
 
 
737 aa  85.9  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  30.95 
 
 
782 aa  79.7  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  30.35 
 
 
797 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  27.56 
 
 
915 aa  74.7  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  20.26 
 
 
1132 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  31.15 
 
 
1037 aa  72.4  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.7 
 
 
769 aa  71.2  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  23.73 
 
 
1111 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  25.32 
 
 
772 aa  67.8  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  20.94 
 
 
1132 aa  67.8  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  29.19 
 
 
733 aa  67.4  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  22.07 
 
 
869 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  24.73 
 
 
1114 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  22.07 
 
 
869 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  22.07 
 
 
869 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  23.18 
 
 
869 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  17.65 
 
 
1068 aa  65.1  0.000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 
825 aa  63.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  22.63 
 
 
911 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 
1177 aa  62.4  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  27.62 
 
 
1246 aa  61.6  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1708  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  27.27 
 
 
504 aa  60.8  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.48 
 
 
785 aa  59.7  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  24.37 
 
 
1002 aa  59.3  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0792  hypothetical protein  30.81 
 
 
714 aa  59.7  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  31.85 
 
 
759 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.81 
 
 
857 aa  58.9  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  20.42 
 
 
923 aa  57.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  20.42 
 
 
924 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  23.44 
 
 
666 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  25.41 
 
 
863 aa  57.4  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  21.99 
 
 
666 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 
773 aa  55.8  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  22.92 
 
 
666 aa  55.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  21.47 
 
 
1143 aa  55.1  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  24.63 
 
 
955 aa  54.7  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  22.4 
 
 
666 aa  55.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  24.87 
 
 
819 aa  54.7  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  27.98 
 
 
988 aa  54.7  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  23.04 
 
 
663 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  25.16 
 
 
666 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  25.81 
 
 
512 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  21.88 
 
 
666 aa  52.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  22.22 
 
 
1038 aa  52  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  23.92 
 
 
1068 aa  52  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  20.87 
 
 
1038 aa  51.2  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl156  unknown substrate ABC transporter permease  22.59 
 
 
1429 aa  50.8  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  23.78 
 
 
666 aa  51.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  23.78 
 
 
666 aa  51.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  29.47 
 
 
695 aa  50.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  22.17 
 
 
1038 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  23.19 
 
 
1041 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  20.63 
 
 
792 aa  50.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  24.84 
 
 
623 aa  50.1  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  24.88 
 
 
767 aa  50.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  25 
 
 
683 aa  49.7  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  29.06 
 
 
882 aa  49.7  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1481  membrane protein-like protein  37.38 
 
 
770 aa  49.3  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0291099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  22.79 
 
 
1038 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  23 
 
 
1041 aa  48.5  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  23.16 
 
 
917 aa  48.5  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2395  hypothetical protein  26.4 
 
 
625 aa  48.1  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.553674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  21.36 
 
 
1038 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  26.67 
 
 
721 aa  47.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  21.97 
 
 
1049 aa  46.6  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.29 
 
 
1211 aa  46.6  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  22.49 
 
 
888 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.28 
 
 
946 aa  46.2  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 
1110 aa  45.8  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1367  hypothetical protein  26.4 
 
 
220 aa  45.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  24.86 
 
 
1040 aa  45.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.97 
 
 
452 aa  45.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  18.55 
 
 
1090 aa  45.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
443 aa  44.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  25.07 
 
 
1232 aa  44.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>