92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0133 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 917 aa  1885    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  50.41 
 
 		 1211 aa  558  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  26.96 
 
 		 947 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  27.34 
 
 		 868 aa  316  9.999999999999999e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  32.81 
 
 		 1016 aa  295  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  29.98 
 
 		 1132 aa  279  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  29.65 
 
 		 1132 aa  276  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  23.93 
 
 		 859 aa  256  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  26.13 
 
 		 876 aa  252  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1090 aa  244  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  32.32 
 
 		 1177 aa  242  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 		 1143 aa  241  5e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 		 1068 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 		 1110 aa  221  7e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  32.47 
 
 		 1232 aa  216  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 		 774 aa  198  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 792 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  24.33 
 
 		 797 aa  150  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  24.18 
 
 		 791 aa  142  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  24.74 
 
 		 792 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  23.36 
 
 		 759 aa  130  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  25.29 
 
 		 793 aa  125  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  21.21 
 
 		 792 aa  122  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  22.97 
 
 		 787 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  24.6 
 
 		 789 aa  107  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  24.87 
 
 		 788 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  25.08 
 
 		 789 aa  100  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  25.08 
 
 		 789 aa  100  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  21.6 
 
 		 787 aa  99  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  24.66 
 
 		 789 aa  99  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  22.55 
 
 		 787 aa  97.8  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 		 787 aa  95.1  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  25.33 
 
 		 787 aa  94.7  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  23.34 
 
 		 787 aa  92.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  23.2 
 
 		 800 aa  91.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  23.5 
 
 		 788 aa  89.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  21.1 
 
 		 788 aa  89.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  23.66 
 
 		 786 aa  89  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  22.86 
 
 		 787 aa  89  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 		 788 aa  89  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  22.6 
 
 		 787 aa  89  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  23.49 
 
 		 787 aa  88.2  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  21.38 
 
 		 773 aa  87.4  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  22.1 
 
 		 787 aa  87  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  22.18 
 
 		 790 aa  85.9  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  20.9 
 
 		 791 aa  84.7  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  23.89 
 
 		 787 aa  84.3  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  22.49 
 
 		 787 aa  81.6  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  24.33 
 
 		 788 aa  78.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  20.89 
 
 		 787 aa  77  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  24.12 
 
 		 787 aa  76.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  23.71 
 
 		 793 aa  75.5  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.52 
 
 		 737 aa  71.6  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  18.82 
 
 		 749 aa  70.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  21.85 
 
 		 793 aa  70.1  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  23.03 
 
 		 787 aa  68.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  21.97 
 
 		 789 aa  64.7  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  24.4 
 
 		 786 aa  61.2  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  19.78 
 
 		 743 aa  60.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 		 786 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  24.15 
 
 		 786 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  22.7 
 
 		 790 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  21.59 
 
 		 789 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  21.72 
 
 		 786 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  24.19 
 
 		 419 aa  53.9  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  33.61 
 
 		 422 aa  52.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  33.61 
 
 		 422 aa  52.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  25.86 
 
 		 410 aa  50.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  21.54 
 
 		 806 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 		 805 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 822 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  35.65 
 
 		 841 aa  48.9  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  30.67 
 
 		 930 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  27.68 
 
 		 419 aa  47.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.58 
 
 		 883 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  31.69 
 
 		 452 aa  47  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 		 407 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  20.45 
 
 		 387 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.5 
 
 		 648 aa  45.8  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  25.5 
 
 		 648 aa  45.4  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.5 
 
 		 648 aa  45.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.5 
 
 		 648 aa  45.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  25.5 
 
 		 648 aa  45.4  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.5 
 
 		 648 aa  45.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  25.5 
 
 		 648 aa  45.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.43 
 
 		 893 aa  45.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  32.71 
 
 		 853 aa  44.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.99 
 
 		 809 aa  45.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  24.85 
 
 		 411 aa  45.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  20.62 
 
 		 896 aa  45.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2448  hypothetical protein  29.08 
 
 		 438 aa  44.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0464598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  26.15 
 
 		 827 aa  44.3  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>