127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1113 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  42.88 
 
 		 1177 aa  857    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 1110 aa  2253    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  37.31 
 
 		 1232 aa  664    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  30.24 
 
 		 1132 aa  547  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  29.28 
 
 		 1132 aa  542  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1090 aa  505  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 		 1016 aa  482  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  35.84 
 
 		 947 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  28.15 
 
 		 1211 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  25.7 
 
 		 1143 aa  383  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  33.58 
 
 		 868 aa  358  2.9999999999999997e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  33.23 
 
 		 859 aa  342  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  22.77 
 
 		 1068 aa  320  1e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  30.56 
 
 		 876 aa  280  8e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  28.55 
 
 		 792 aa  253  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 		 917 aa  240  8e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  32.25 
 
 		 774 aa  228  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  26.91 
 
 		 791 aa  188  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 792 aa  187  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  27.67 
 
 		 787 aa  163  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  27.37 
 
 		 787 aa  137  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  25.68 
 
 		 787 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  26.66 
 
 		 786 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  24.68 
 
 		 787 aa  132  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 		 787 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  25.13 
 
 		 773 aa  130  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  26.22 
 
 		 793 aa  129  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 797 aa  128  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  28.52 
 
 		 789 aa  127  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  26.28 
 
 		 788 aa  127  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 759 aa  127  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  25.36 
 
 		 787 aa  125  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  25.21 
 
 		 787 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 		 792 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  26.13 
 
 		 787 aa  117  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  24.13 
 
 		 800 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 788 aa  115  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 		 787 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  25.83 
 
 		 790 aa  112  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  24.32 
 
 		 787 aa  112  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 		 787 aa  111  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  24.8 
 
 		 790 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  26.18 
 
 		 787 aa  107  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  23.54 
 
 		 788 aa  107  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  24.27 
 
 		 788 aa  105  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  24.26 
 
 		 787 aa  105  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  24.96 
 
 		 787 aa  103  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 		 789 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 		 789 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  23.29 
 
 		 787 aa  100  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  25.27 
 
 		 793 aa  98.6  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  23.75 
 
 		 749 aa  95.5  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  24.26 
 
 		 789 aa  95.1  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  25.18 
 
 		 793 aa  92  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  26.03 
 
 		 788 aa  89.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  24.01 
 
 		 791 aa  86.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  23.65 
 
 		 789 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  27.23 
 
 		 786 aa  84.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 786 aa  83.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  20 
 
 		 737 aa  81.6  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  26.81 
 
 		 786 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1092 aa  81.3  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  22.38 
 
 		 789 aa  74.3  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  23.7 
 
 		 849 aa  59.7  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  23.09 
 
 		 743 aa  59.3  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.48 
 
 		 692 aa  59.3  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 		 806 aa  59.3  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.87 
 
 		 847 aa  59.3  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  25 
 
 		 1038 aa  57.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  27.12 
 
 		 404 aa  55.8  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  26.91 
 
 		 839 aa  55.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  23.33 
 
 		 786 aa  55.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  21.04 
 
 		 412 aa  54.3  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.85 
 
 		 835 aa  53.5  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  37.84 
 
 		 422 aa  53.5  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  27.35 
 
 		 419 aa  53.5  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  26.25 
 
 		 840 aa  53.5  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  21.37 
 
 		 842 aa  53.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  32.24 
 
 		 791 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.47 
 
 		 408 aa  52  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  37.84 
 
 		 422 aa  52  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.29 
 
 		 797 aa  52  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 		 413 aa  51.6  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  34.12 
 
 		 853 aa  51.6  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  22.43 
 
 		 1038 aa  50.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  21.56 
 
 		 362 aa  50.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  20.68 
 
 		 1038 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.59 
 
 		 880 aa  49.7  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  21.58 
 
 		 666 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 838 aa  49.3  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  23.8 
 
 		 825 aa  48.9  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  20.68 
 
 		 888 aa  48.5  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  20.68 
 
 		 1041 aa  48.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  28.57 
 
 		 843 aa  47.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  23.2 
 
 		 887 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  21.85 
 
 		 878 aa  47.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  32.76 
 
 		 443 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  35.21 
 
 		 829 aa  47.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  20.75 
 
 		 1038 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 		 379 aa  47.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>