80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4368 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  44.29 
 
 		 788 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  43.2 
 
 		 787 aa  657    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  70.72 
 
 		 789 aa  1159    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  72.88 
 
 		 789 aa  1126    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 789 aa  1581    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 789 aa  1581    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  42.19 
 
 		 787 aa  623  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  42.19 
 
 		 788 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  41.2 
 
 		 787 aa  606  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  39.77 
 
 		 787 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  42.6 
 
 		 787 aa  598  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  41.8 
 
 		 787 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  42.03 
 
 		 793 aa  585  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  39.77 
 
 		 787 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  40.15 
 
 		 787 aa  551  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  39.26 
 
 		 787 aa  545  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  41 
 
 		 793 aa  546  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  35.79 
 
 		 788 aa  541  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  39.7 
 
 		 788 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  39.92 
 
 		 789 aa  527  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  39.92 
 
 		 790 aa  526  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  39.87 
 
 		 787 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  38.61 
 
 		 800 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  38.19 
 
 		 787 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  38.12 
 
 		 787 aa  502  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  38.07 
 
 		 786 aa  505  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  41.47 
 
 		 786 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  37.66 
 
 		 791 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  37.44 
 
 		 787 aa  492  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  39.16 
 
 		 786 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  38.65 
 
 		 786 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  38.14 
 
 		 786 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  37.82 
 
 		 788 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  36.9 
 
 		 787 aa  461  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  36.91 
 
 		 793 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  36.48 
 
 		 789 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  38.05 
 
 		 790 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  30.78 
 
 		 792 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  30.68 
 
 		 791 aa  359  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  27.43 
 
 		 792 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 		 792 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  25.96 
 
 		 797 aa  263  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  26.25 
 
 		 787 aa  254  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  23.79 
 
 		 774 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  24.16 
 
 		 1132 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  23.98 
 
 		 1132 aa  154  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  24.15 
 
 		 947 aa  154  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 		 1177 aa  136  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1090 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  23.81 
 
 		 868 aa  126  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  26.7 
 
 		 1232 aa  122  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  22.47 
 
 		 1016 aa  118  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  21.16 
 
 		 859 aa  117  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  19.09 
 
 		 773 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  20.58 
 
 		 876 aa  105  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  20.97 
 
 		 1143 aa  100  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  25.08 
 
 		 917 aa  96.7  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  21.07 
 
 		 743 aa  91.7  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 		 1110 aa  89.7  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  25 
 
 		 806 aa  87  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  20.66 
 
 		 759 aa  86.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.42 
 
 		 737 aa  84.7  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  19.57 
 
 		 1068 aa  83.6  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  25.45 
 
 		 876 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  26.28 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  22.93 
 
 		 749 aa  57.8  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.02 
 
 		 1211 aa  57.4  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.44 
 
 		 386 aa  55.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3804  protein of unknown function DUF214  21.08 
 
 		 378 aa  51.2  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.62 
 
 		 759 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  22.98 
 
 		 850 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 		 952 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  24.29 
 
 		 414 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  21.95 
 
 		 833 aa  48.5  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.71 
 
 		 415 aa  48.1  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1961  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 		 845 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1118  hypothetical protein  24.71 
 
 		 661 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279794 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  23.32 
 
 		 416 aa  45.8  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf117  ABC transporter permease protein  23.62 
 
 		 2777 aa  45.8  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.247181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  23.91 
 
 		 847 aa  44.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>