158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1701 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  53.09 
 
 
793 aa  805    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  43.71 
 
 
787 aa  648    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  100 
 
 
787 aa  1575    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  50.32 
 
 
789 aa  728    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  43.33 
 
 
787 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  45.73 
 
 
791 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  43.81 
 
 
787 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  50.44 
 
 
787 aa  772    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  51.59 
 
 
787 aa  811    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  45.62 
 
 
786 aa  655    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  44.22 
 
 
789 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  42.95 
 
 
787 aa  660    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  44.12 
 
 
787 aa  630  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  45.24 
 
 
787 aa  627  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  42.6 
 
 
789 aa  621  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  42.6 
 
 
789 aa  621  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  39.77 
 
 
788 aa  616  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  41.3 
 
 
787 aa  615  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  41.55 
 
 
788 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  42.98 
 
 
788 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  44.42 
 
 
789 aa  599  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  42.97 
 
 
787 aa  602  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  41.3 
 
 
787 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  41.78 
 
 
800 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  42.18 
 
 
788 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  41.42 
 
 
787 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  42.84 
 
 
793 aa  569  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  42.46 
 
 
790 aa  566  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  42.23 
 
 
788 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  42.73 
 
 
786 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  39.59 
 
 
793 aa  538  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  42.48 
 
 
786 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  41.3 
 
 
786 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  41.24 
 
 
790 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  40.38 
 
 
787 aa  520  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  40.21 
 
 
786 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  39.03 
 
 
789 aa  475  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  32.29 
 
 
792 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  29.91 
 
 
791 aa  361  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 
792 aa  343  8e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 
792 aa  324  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  30.41 
 
 
787 aa  307  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 
797 aa  299  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  24.35 
 
 
774 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  24.65 
 
 
947 aa  171  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  23.4 
 
 
1132 aa  142  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  22.37 
 
 
1090 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 
1177 aa  137  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  23.16 
 
 
1132 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  21.05 
 
 
773 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  25.73 
 
 
1110 aa  125  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  23.22 
 
 
868 aa  124  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  26.33 
 
 
1232 aa  120  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  22.8 
 
 
1016 aa  115  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  22.3 
 
 
859 aa  115  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.71 
 
 
737 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  22.35 
 
 
876 aa  102  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  20.79 
 
 
1068 aa  101  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 
1143 aa  94.4  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  23.26 
 
 
917 aa  94.4  8e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  19.55 
 
 
743 aa  79.7  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  22.37 
 
 
759 aa  76.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  26.3 
 
 
1211 aa  71.6  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  26.56 
 
 
806 aa  70.5  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  26.28 
 
 
876 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1740  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28 
 
 
411 aa  62.8  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.2 
 
 
386 aa  62  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  25.63 
 
 
845 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  19.75 
 
 
749 aa  58.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.64 
 
 
414 aa  58.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3859  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.1 
 
 
416 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1609  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.16 
 
 
414 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0146346  normal  0.0646675 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  26.23 
 
 
362 aa  56.6  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  26.28 
 
 
836 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.03 
 
 
415 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0787  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.92 
 
 
411 aa  55.1  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000127174  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0781  ABC lipoprotein exporter, inner membrane subunit, LolE  25.25 
 
 
411 aa  54.7  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206341  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1697  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.77 
 
 
413 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 
838 aa  54.3  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.23 
 
 
839 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25450  hypothetical protein  24.27 
 
 
433 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14690  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  24.6 
 
 
416 aa  53.5  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2577  ABC transporter, permease protein  20.61 
 
 
779 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000406057  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  27.03 
 
 
829 aa  53.5  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2156  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.46 
 
 
413 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3586  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.46 
 
 
413 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2175  hypothetical protein  24.27 
 
 
414 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1671  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.03 
 
 
416 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.966628  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  26.05 
 
 
827 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.71 
 
 
849 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1673  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.2 
 
 
413 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2512  ABC transporter, permease protein  19.49 
 
 
775 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00525405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2228  ABC transporter, permease  19.49 
 
 
779 aa  52  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.622849  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  24.09 
 
 
393 aa  52.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25430  hypothetical protein  24.67 
 
 
416 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2173  hypothetical protein  24.33 
 
 
416 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  24.41 
 
 
416 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.27 
 
 
421 aa  51.6  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  28.86 
 
 
416 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  24.34 
 
 
416 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>