150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1206 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  100 
 
 		 868 aa  1767    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  41.85 
 
 		 859 aa  693    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  37.78 
 
 		 876 aa  591  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  31.3 
 
 		 947 aa  500  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 		 1132 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  38.88 
 
 		 1132 aa  452  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  34.38 
 
 		 1016 aa  361  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  35.44 
 
 		 1143 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1090 aa  350  5e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  33.96 
 
 		 1177 aa  335  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  33.58 
 
 		 1110 aa  324  6e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 		 1068 aa  318  3e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  27.45 
 
 		 917 aa  308  4.0000000000000004e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  33.85 
 
 		 1232 aa  306  9.000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  29.28 
 
 		 1211 aa  285  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 		 792 aa  233  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  29.93 
 
 		 774 aa  224  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  23.68 
 
 		 797 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 		 792 aa  138  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  24.29 
 
 		 791 aa  138  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  21.63 
 
 		 759 aa  134  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  22.39 
 
 		 787 aa  130  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  22.74 
 
 		 787 aa  127  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 		 789 aa  126  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 		 789 aa  126  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  23.68 
 
 		 793 aa  124  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  25.43 
 
 		 788 aa  124  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  21.97 
 
 		 787 aa  124  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 792 aa  122  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  25.55 
 
 		 787 aa  121  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  22.62 
 
 		 787 aa  118  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  23.57 
 
 		 787 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  22.43 
 
 		 791 aa  117  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  23.3 
 
 		 787 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  22.82 
 
 		 787 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  21.66 
 
 		 786 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  21.93 
 
 		 787 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  22.93 
 
 		 788 aa  111  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  22.81 
 
 		 788 aa  110  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  23.84 
 
 		 788 aa  109  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  23.95 
 
 		 788 aa  107  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  22.49 
 
 		 790 aa  107  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  23.05 
 
 		 793 aa  106  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  22.22 
 
 		 787 aa  106  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 		 737 aa  105  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 		 773 aa  105  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  21.92 
 
 		 793 aa  99.4  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  23.44 
 
 		 800 aa  97.8  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  21.79 
 
 		 787 aa  96.3  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  21.23 
 
 		 789 aa  95.9  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  25.17 
 
 		 787 aa  94.4  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  21.42 
 
 		 789 aa  94.4  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  21.85 
 
 		 787 aa  94  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  21.43 
 
 		 787 aa  93.2  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 		 786 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 		 787 aa  91.3  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  23.53 
 
 		 789 aa  90.9  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  21.07 
 
 		 790 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  22.48 
 
 		 749 aa  89.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 		 786 aa  85.1  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  22.74 
 
 		 786 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  20.78 
 
 		 789 aa  72.8  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.11 
 
 		 387 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  23.53 
 
 		 838 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  21.66 
 
 		 786 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  28.36 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  22.69 
 
 		 859 aa  57.4  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  25.91 
 
 		 464 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  25.35 
 
 		 871 aa  55.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  27.36 
 
 		 379 aa  55.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  39.53 
 
 		 829 aa  55.1  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  33.71 
 
 		 444 aa  54.7  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  21.79 
 
 		 386 aa  54.3  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  24.23 
 
 		 419 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  23.33 
 
 		 836 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.97 
 
 		 413 aa  53.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  23.43 
 
 		 825 aa  52.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  20.89 
 
 		 743 aa  52.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 		 857 aa  52  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  24.23 
 
 		 383 aa  52  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 		 385 aa  51.6  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 		 848 aa  51.6  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  20.54 
 
 		 851 aa  51.2  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  23.26 
 
 		 821 aa  51.6  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  21.54 
 
 		 930 aa  51.2  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  20.98 
 
 		 853 aa  51.2  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf117  ABC transporter permease protein  22.46 
 
 		 2777 aa  51.2  0.00008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.247181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  29.29 
 
 		 853 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  22.22 
 
 		 847 aa  50.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 		 405 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  27 
 
 		 834 aa  50.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  26.77 
 
 		 404 aa  49.3  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  23.3 
 
 		 385 aa  49.7  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.7 
 
 		 805 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  23.73 
 
 		 393 aa  48.9  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  23.04 
 
 		 397 aa  49.3  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  22.5 
 
 		 833 aa  48.9  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  33.71 
 
 		 434 aa  48.9  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  33.33 
 
 		 388 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>