133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1003 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1003  permease, putative  100 
 
 
876 aa  1773    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  37.78 
 
 
868 aa  596  1e-169  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  35.96 
 
 
859 aa  535  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  27.92 
 
 
947 aa  379  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  33.58 
 
 
1132 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  34.88 
 
 
1132 aa  366  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  32.86 
 
 
1016 aa  293  9e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  32.39 
 
 
1143 aa  280  9e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  32.48 
 
 
1068 aa  273  9e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  30.47 
 
 
1177 aa  273  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  31.38 
 
 
1090 aa  262  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  30.02 
 
 
1110 aa  254  6e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 
917 aa  249  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  29.97 
 
 
1232 aa  247  6.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  26.86 
 
 
1211 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  24.31 
 
 
792 aa  197  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  29.14 
 
 
774 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  28.23 
 
 
792 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  23.2 
 
 
791 aa  159  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  22.94 
 
 
797 aa  135  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  21.55 
 
 
787 aa  118  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  22.13 
 
 
792 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  22.93 
 
 
787 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  23.77 
 
 
773 aa  113  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  22.84 
 
 
788 aa  112  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  22.29 
 
 
787 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  20.58 
 
 
789 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  21.94 
 
 
759 aa  105  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  20.58 
 
 
789 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 
787 aa  105  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  24.58 
 
 
793 aa  103  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  21.67 
 
 
788 aa  103  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  21.62 
 
 
787 aa  100  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  21.84 
 
 
789 aa  98.6  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  21.03 
 
 
787 aa  97.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  21.26 
 
 
793 aa  95.5  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  22.56 
 
 
787 aa  95.1  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  21.89 
 
 
787 aa  94.7  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  22.62 
 
 
788 aa  94.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  22.18 
 
 
787 aa  91.7  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  21.24 
 
 
787 aa  91.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  23.19 
 
 
787 aa  91.3  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  21.9 
 
 
791 aa  90.1  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  20.93 
 
 
800 aa  89  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  20.91 
 
 
737 aa  88.6  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  20.48 
 
 
789 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  19.54 
 
 
787 aa  85.9  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  19.64 
 
 
790 aa  84  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  21.49 
 
 
787 aa  82.4  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  20.66 
 
 
793 aa  80.1  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  21.66 
 
 
787 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  20.37 
 
 
789 aa  79.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 
786 aa  79.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  21.22 
 
 
786 aa  78.2  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  22.03 
 
 
788 aa  78.2  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  25.36 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  21.1 
 
 
788 aa  77.8  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 
786 aa  77.8  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  20.95 
 
 
786 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  22.18 
 
 
787 aa  74.3  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  20.7 
 
 
749 aa  72.4  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  19.11 
 
 
789 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  19.96 
 
 
790 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  26.41 
 
 
386 aa  59.3  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  29.71 
 
 
414 aa  56.2  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.71 
 
 
414 aa  56.2  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  23.77 
 
 
393 aa  55.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.26 
 
 
386 aa  55.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  21.68 
 
 
393 aa  54.7  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  21.68 
 
 
376 aa  54.3  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  22.81 
 
 
863 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  27.78 
 
 
425 aa  51.6  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  22.22 
 
 
385 aa  50.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  23.21 
 
 
402 aa  50.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  21.64 
 
 
849 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  22.39 
 
 
849 aa  50.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  20.86 
 
 
743 aa  50.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.33 
 
 
406 aa  50.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.46 
 
 
843 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  28.95 
 
 
434 aa  49.3  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 
385 aa  49.7  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  21.68 
 
 
385 aa  49.3  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
859 aa  48.5  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.43 
 
 
805 aa  48.5  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  21.94 
 
 
835 aa  48.9  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.36 
 
 
414 aa  48.5  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299394  normal  0.273871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 
378 aa  48.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  22.03 
 
 
385 aa  47.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  22.67 
 
 
430 aa  47.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  22.67 
 
 
430 aa  47.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  21.67 
 
 
407 aa  47.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  19.94 
 
 
425 aa  47.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  20 
 
 
856 aa  47.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  25.41 
 
 
786 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  20.44 
 
 
385 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  24.15 
 
 
379 aa  46.6  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  28.15 
 
 
454 aa  47  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  24.34 
 
 
414 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  28.19 
 
 
429 aa  46.6  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  21.3 
 
 
817 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>