185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0989 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  98.18 
 
 
385 aa  763    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
385 aa  777    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  71.17 
 
 
385 aa  549  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  69.87 
 
 
385 aa  532  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  66.23 
 
 
385 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  60 
 
 
385 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  53.39 
 
 
386 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  56.36 
 
 
384 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  55.35 
 
 
383 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  55.84 
 
 
384 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  55.32 
 
 
384 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  56.1 
 
 
384 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  55.58 
 
 
384 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  56.1 
 
 
384 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  55.32 
 
 
384 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  55.06 
 
 
384 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  53.77 
 
 
384 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  50.39 
 
 
385 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  56.36 
 
 
384 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.25 
 
 
382 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  34.92 
 
 
387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  35.88 
 
 
385 aa  202  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  38.19 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  37.07 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  37.03 
 
 
385 aa  196  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  32.04 
 
 
388 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  30.93 
 
 
379 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  30.03 
 
 
379 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.76 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  23 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3165  protein of unknown function DUF214  19.38 
 
 
422 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.296163  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  23.71 
 
 
868 aa  61.2  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  21.45 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.2 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 
848 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.11 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  21.25 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.83 
 
 
415 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14690  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  22.42 
 
 
416 aa  57  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  31.21 
 
 
419 aa  57  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  22.56 
 
 
876 aa  56.6  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  28.96 
 
 
462 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  21.55 
 
 
397 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2173  hypothetical protein  22.71 
 
 
416 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 
792 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1156  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.87 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342008  normal  0.0203303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25430  hypothetical protein  22.7 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1673  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.63 
 
 
413 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  23.42 
 
 
1143 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  21.72 
 
 
386 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  30.41 
 
 
431 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  21.84 
 
 
859 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  22.89 
 
 
414 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0277  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
431 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  23.57 
 
 
397 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  21.14 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5420  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.26 
 
 
417 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2151  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.32 
 
 
417 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738534  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  22.85 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  24.03 
 
 
821 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2024  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.32 
 
 
417 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  22.29 
 
 
947 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  22.54 
 
 
412 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2156  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.45 
 
 
413 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5963  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.61 
 
 
417 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2114  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.61 
 
 
417 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08589  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.9 
 
 
415 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.17 
 
 
417 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.13 
 
 
416 aa  49.7  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.76 
 
 
416 aa  49.7  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1697  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.91 
 
 
413 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934342 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2584  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.76 
 
 
417 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297179  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2639  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.76 
 
 
417 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  23.53 
 
 
397 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  23.93 
 
 
788 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2132  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.26 
 
 
417 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.435353  normal  0.150883 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  27.56 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  22.22 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  23.08 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  21.08 
 
 
1016 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  24.1 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1696  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  23.76 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2718  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  23.76 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  24.11 
 
 
448 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  34.26 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  24.48 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  26.11 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3231  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.3 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113164  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5136  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.3 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433144  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  27.56 
 
 
806 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2201  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  23.76 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.38 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3117  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  23.76 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1474  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  23.76 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3586  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.09 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  21.5 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  22.31 
 
 
409 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.21 
 
 
415 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>