100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4267 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  66.46 
 
 		 788 aa  980    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  67.84 
 
 		 790 aa  983    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  57.05 
 
 		 787 aa  857    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  100 
 
 		 793 aa  1567    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  45.85 
 
 		 787 aa  622  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  42.61 
 
 		 787 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  42.84 
 
 		 787 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  42.64 
 
 		 793 aa  571  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  42.24 
 
 		 800 aa  562  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  42.57 
 
 		 788 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  42.03 
 
 		 786 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  43.47 
 
 		 789 aa  553  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  39.95 
 
 		 787 aa  545  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  38.81 
 
 		 788 aa  545  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  39.77 
 
 		 787 aa  530  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  41.18 
 
 		 787 aa  525  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  42.3 
 
 		 790 aa  523  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  40.15 
 
 		 787 aa  522  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  41.66 
 
 		 787 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  38.6 
 
 		 787 aa  498  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  39.95 
 
 		 787 aa  496  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  37.14 
 
 		 789 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  39.95 
 
 		 788 aa  496  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  38.75 
 
 		 787 aa  495  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  39.04 
 
 		 791 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  37.15 
 
 		 789 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  37.15 
 
 		 789 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  41.46 
 
 		 786 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  37.77 
 
 		 788 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  41.46 
 
 		 786 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  41.21 
 
 		 786 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  37.52 
 
 		 789 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  39.22 
 
 		 787 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  36.18 
 
 		 787 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  37.88 
 
 		 793 aa  429  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  38.36 
 
 		 789 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  39.37 
 
 		 786 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  29.85 
 
 		 791 aa  330  8e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  29.3 
 
 		 792 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  29.89 
 
 		 792 aa  294  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  27.05 
 
 		 797 aa  283  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 		 792 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  28.34 
 
 		 787 aa  249  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  21.23 
 
 		 773 aa  158  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 774 aa  158  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  26.06 
 
 		 947 aa  150  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  26.53 
 
 		 1177 aa  144  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  23.68 
 
 		 868 aa  139  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  23.12 
 
 		 1132 aa  137  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1090 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  22.32 
 
 		 1132 aa  128  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  25.24 
 
 		 917 aa  120  7e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  22.28 
 
 		 1016 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  26.57 
 
 		 1110 aa  117  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  25.91 
 
 		 1232 aa  117  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  23.27 
 
 		 759 aa  116  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  22.49 
 
 		 737 aa  107  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  21.26 
 
 		 876 aa  106  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  21.25 
 
 		 859 aa  100  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  21.59 
 
 		 1143 aa  94.7  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.86 
 
 		 1211 aa  81.3  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  18.02 
 
 		 1068 aa  79.3  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  26.45 
 
 		 806 aa  76.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  21.17 
 
 		 743 aa  72.8  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  25.17 
 
 		 876 aa  60.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  20.43 
 
 		 749 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  28.79 
 
 		 400 aa  51.6  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.27 
 
 		 851 aa  51.2  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 		 416 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2228  ABC transporter, permease  23.9 
 
 		 779 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.622849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1613  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 779 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.0478935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  24.21 
 
 		 848 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.44 
 
 		 855 aa  48.9  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2512  ABC transporter, permease protein  23.9 
 
 		 775 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00525405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  28.28 
 
 		 400 aa  48.5  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0065  ABC transporter permease  29.82 
 
 		 772 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  21.93 
 
 		 821 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  24.34 
 
 		 850 aa  47.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  33.78 
 
 		 408 aa  47  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 		 806 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 		 846 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  32.37 
 
 		 841 aa  46.6  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 		 838 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2274  ABC transporter, permease  22.89 
 
 		 779 aa  46.6  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000117587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2502  ABC transporter, permease protein  22.89 
 
 		 735 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0218  protein of unknown function DUF214  22.44 
 
 		 379 aa  45.8  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  22.41 
 
 		 852 aa  46.2  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  27.5 
 
 		 413 aa  45.8  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 833 aa  45.8  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2577  ABC transporter, permease protein  23.27 
 
 		 779 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000406057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.5 
 
 		 849 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  22.57 
 
 		 856 aa  45.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2481  ABC transporter permease  22.89 
 
 		 779 aa  45.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00745912  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  24.3 
 
 		 383 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2306  ABC transporter permease  22.89 
 
 		 779 aa  45.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  22.91 
 
 		 411 aa  44.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  22.56 
 
 		 400 aa  44.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  23.86 
 
 		 400 aa  44.3  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  25.08 
 
 		 828 aa  44.3  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  31.78 
 
 		 393 aa  44.3  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>