126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0230 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  80 
 
 
400 aa  635    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  83.25 
 
 
400 aa  678    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
400 aa  809    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  77.25 
 
 
400 aa  620  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  68.09 
 
 
399 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  43.86 
 
 
377 aa  342  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  43.75 
 
 
380 aa  333  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  40.69 
 
 
381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  44.03 
 
 
399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  43.53 
 
 
399 aa  327  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  42.75 
 
 
397 aa  326  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  42.25 
 
 
397 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  43.56 
 
 
401 aa  315  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  41.83 
 
 
401 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  41.83 
 
 
401 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  41.83 
 
 
401 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  41.34 
 
 
401 aa  310  4e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  41.98 
 
 
401 aa  309  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  42.08 
 
 
401 aa  309  6.999999999999999e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  41.58 
 
 
401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  42.72 
 
 
401 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  42.54 
 
 
406 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  40.3 
 
 
397 aa  297  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  42.25 
 
 
397 aa  295  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  42.68 
 
 
399 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  41.25 
 
 
397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  41.58 
 
 
401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  40.94 
 
 
400 aa  269  7e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  40.84 
 
 
400 aa  256  7e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  39.95 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  40.69 
 
 
400 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  32.83 
 
 
381 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  21.09 
 
 
349 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  24.57 
 
 
377 aa  86.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  22.46 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  23.52 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  24.28 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  23.31 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  21.63 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  23.24 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  22.06 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  22.17 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  23 
 
 
354 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  23 
 
 
354 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  23 
 
 
354 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  22.76 
 
 
354 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  23.13 
 
 
374 aa  63.5  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 
355 aa  63.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  20.61 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  22.76 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  22.52 
 
 
354 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.72 
 
 
375 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  20.49 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  20.49 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  21.72 
 
 
378 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  19.24 
 
 
378 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  23 
 
 
354 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  23 
 
 
354 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  27.27 
 
 
385 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  19.81 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  20.92 
 
 
392 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  20.58 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  26.29 
 
 
385 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  22.76 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  25 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 
368 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  21.34 
 
 
378 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  22.63 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  21.79 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  21.51 
 
 
376 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  19.95 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  21.05 
 
 
372 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  30 
 
 
392 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  25.89 
 
 
388 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  21.22 
 
 
378 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  22.14 
 
 
351 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  22.14 
 
 
351 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  21.91 
 
 
392 aa  53.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  22.17 
 
 
350 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  21.55 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  21.75 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  24.42 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  21.55 
 
 
378 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  27.45 
 
 
410 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  21.55 
 
 
378 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  21.55 
 
 
378 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  21.55 
 
 
378 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  30.63 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  22.41 
 
 
380 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  23.56 
 
 
356 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  29.2 
 
 
349 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  25 
 
 
385 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  24.55 
 
 
384 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  22.57 
 
 
380 aa  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  23.43 
 
 
389 aa  49.7  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  20.59 
 
 
415 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  23.13 
 
 
349 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  23.13 
 
 
349 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>