131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1117 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 381 aa  773    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  42.33 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  41.34 
 
 		 386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  39.95 
 
 		 380 aa  299  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  37.1 
 
 		 366 aa  259  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  33.94 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  30.61 
 
 		 378 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  32.02 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 		 378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 		 378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 		 378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 		 378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 		 378 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  31.5 
 
 		 378 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  30.89 
 
 		 384 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  32.29 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  32.9 
 
 		 398 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  30.99 
 
 		 378 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  30.29 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  30.15 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  30.29 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  32.37 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  32.37 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  31.35 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  32.39 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  30.29 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 		 376 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  30.73 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  29.74 
 
 		 380 aa  153  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.44 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  27.2 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  25.65 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  24.23 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  25.59 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  26.77 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  26.99 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  22.59 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  23.87 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  25.56 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  25 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  22.56 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  22.28 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  22.96 
 
 		 383 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  23.96 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  23 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  22.72 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  25.43 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  28.15 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  23.17 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  23.5 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  22.34 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  23.1 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  25.19 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  22.7 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  23.99 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  22.28 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  21.3 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  21.76 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  21.39 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  22.06 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  31.91 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  31.91 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  31.91 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  31.91 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  30.73 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  22.19 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  20.84 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  21.39 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  22.56 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  21.39 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  22.22 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  30.11 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  20.3 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  20.99 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  28.65 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  28.19 
 
 		 400 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  30.6 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  24.38 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  21.84 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  27.42 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  27.87 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  21.5 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  21.5 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  22.97 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  27.13 
 
 		 400 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  26.49 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  22.08 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  21.07 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  21.53 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  26.76 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  21.23 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  26.39 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3338  hypothetical protein  23.04 
 
 		 401 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>