80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1744 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 380 aa  750    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  49.61 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  45.71 
 
 		 368 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.41 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  30.26 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  30.26 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  37.95 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  31.25 
 
 		 354 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  31.25 
 
 		 354 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  30.45 
 
 		 354 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 		 354 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  30.18 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  29.74 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  30.45 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  36.99 
 
 		 368 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  36.58 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  34.77 
 
 		 361 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  33.68 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  35.96 
 
 		 357 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  25.39 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  32.98 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  27.37 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  27.37 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  26.77 
 
 		 349 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  26.04 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  26.18 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  26.05 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  25.65 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  24.08 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04050  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  35.32 
 
 		 328 aa  113  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.057296 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  24.48 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  24.61 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  24.94 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  24.61 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  23.2 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  24.09 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  24.09 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  25.38 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  22.57 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 		 878 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  33.82 
 
 		 848 aa  53.1  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1470  hypothetical protein  27.99 
 
 		 404 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  29.56 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  28.33 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2826  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  31.68 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  26.71 
 
 		 841 aa  49.7  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  23.12 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 853 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  23.16 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  31.94 
 
 		 845 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  25.74 
 
 		 821 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  29.2 
 
 		 855 aa  47  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  35.04 
 
 		 852 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.23 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  24.93 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  21.86 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  20.95 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 838 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  23.17 
 
 		 791 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  26.7 
 
 		 838 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  29.63 
 
 		 854 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  33.33 
 
 		 815 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  32 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  30.08 
 
 		 871 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  25.95 
 
 		 804 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6489  protein of unknown function DUF214  24.19 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  26.04 
 
 		 416 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 		 897 aa  43.1  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  24.15 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 		 822 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3827  hypothetical protein  23.23 
 
 		 408 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>