66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4149 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  693    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  60.22 
 
 
368 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  51.7 
 
 
383 aa  311  9e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  47.35 
 
 
331 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  42.71 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  44.69 
 
 
357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  40.87 
 
 
355 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  44.86 
 
 
351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  42.03 
 
 
347 aa  202  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  34.77 
 
 
380 aa  176  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  35.62 
 
 
368 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  34.81 
 
 
375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04050  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  37.53 
 
 
328 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.057296 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  24.39 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  23.97 
 
 
354 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 
354 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 
354 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  23.71 
 
 
354 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  24.37 
 
 
354 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  23.71 
 
 
354 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  24.21 
 
 
354 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  24.47 
 
 
354 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  24.47 
 
 
354 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  24.47 
 
 
354 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  24.02 
 
 
353 aa  99.4  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  25.14 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  24.47 
 
 
348 aa  96.7  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  21.61 
 
 
350 aa  94  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  24.8 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  25.41 
 
 
348 aa  89  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  25.14 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  25.95 
 
 
349 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  25.95 
 
 
349 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  26.15 
 
 
348 aa  82  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  24.93 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  22.91 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  22.91 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  21.76 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  25.53 
 
 
349 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  24.88 
 
 
386 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.13 
 
 
414 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 
405 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  21.96 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  26.47 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  31.51 
 
 
408 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 
386 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  29.3 
 
 
404 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3628  lipoprotein ABC transporter, permease  35.44 
 
 
407 aa  46.6  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  18.11 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0392  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.27 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0718  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.7 
 
 
835 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  29.53 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  27.4 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.19 
 
 
420 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.17 
 
 
386 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02435  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  30.17 
 
 
471 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.487659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  25.34 
 
 
408 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 
386 aa  43.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2404  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.87 
 
 
410 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.041887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.17 
 
 
415 aa  42.7  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1094  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 
969 aa  42.7  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.58 
 
 
436 aa  42.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489126  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2393  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.87 
 
 
410 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000160813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.87 
 
 
410 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.173381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>