42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1094 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1094  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
969 aa  1853    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0061  protein of unknown function DUF214  34.75 
 
 
1039 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.221236 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1482  protein of unknown function DUF214  31.88 
 
 
1411 aa  75.5  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.356591  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  26.86 
 
 
397 aa  51.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  27.66 
 
 
406 aa  50.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 
386 aa  50.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  30.18 
 
 
854 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  35.9 
 
 
838 aa  49.3  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  28.37 
 
 
391 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  28.37 
 
 
383 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  28.37 
 
 
384 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  28.37 
 
 
391 aa  48.9  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  28.37 
 
 
391 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  28.37 
 
 
391 aa  48.9  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  28.37 
 
 
391 aa  48.9  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  23.81 
 
 
420 aa  48.5  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  28.37 
 
 
383 aa  48.5  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  28.37 
 
 
391 aa  48.5  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.79 
 
 
452 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.43 
 
 
863 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  42.86 
 
 
416 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  42.86 
 
 
416 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  29.03 
 
 
427 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  25.5 
 
 
396 aa  47.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  29.03 
 
 
414 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.5 
 
 
397 aa  46.2  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  34.75 
 
 
858 aa  46.2  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  36.46 
 
 
866 aa  45.8  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.14 
 
 
406 aa  45.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 
408 aa  45.8  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  30.83 
 
 
654 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  33.75 
 
 
402 aa  45.8  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  33.06 
 
 
666 aa  45.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  37.17 
 
 
640 aa  45.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  26.95 
 
 
383 aa  45.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  22.52 
 
 
457 aa  45.1  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  26.32 
 
 
662 aa  45.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  26.83 
 
 
651 aa  44.7  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.76 
 
 
417 aa  44.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  42.11 
 
 
841 aa  44.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  30 
 
 
393 aa  44.3  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  41.07 
 
 
415 aa  44.3  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>