70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2484 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
368 aa  692    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  48.54 
 
 
368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  46.63 
 
 
331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  43.7 
 
 
361 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  42.12 
 
 
383 aa  223  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  46.49 
 
 
351 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  39.73 
 
 
355 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  39.64 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  41.73 
 
 
347 aa  192  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  37.4 
 
 
368 aa  185  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  42.86 
 
 
357 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  37.22 
 
 
375 aa  140  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  26.01 
 
 
354 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  26.01 
 
 
354 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04050  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  38.72 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.057296 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  25.74 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  25.74 
 
 
354 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  25.74 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  25.47 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  25.74 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  25.2 
 
 
354 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  25.2 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  25.2 
 
 
354 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  23.39 
 
 
350 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  26.08 
 
 
356 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  95.9  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  95.9  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  22.76 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  23.51 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  23.39 
 
 
357 aa  89.7  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  20.55 
 
 
362 aa  86.3  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  23.1 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  22.76 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  22.05 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  22.98 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  22.48 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  20.11 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  22.43 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  22.43 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  24.59 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  24.81 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  22.71 
 
 
400 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  28.48 
 
 
378 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  28.48 
 
 
378 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  27.67 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 
378 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  27.33 
 
 
378 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  24.25 
 
 
400 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  33.08 
 
 
408 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  24.2 
 
 
376 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  41.67 
 
 
845 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  27.8 
 
 
787 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  26.83 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.53 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  41.77 
 
 
848 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  29.12 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  32.58 
 
 
841 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  33.7 
 
 
372 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  24.71 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  25.25 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3628  lipoprotein ABC transporter, permease  33.33 
 
 
407 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  35.11 
 
 
374 aa  43.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  33.58 
 
 
852 aa  43.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  31.03 
 
 
789 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>