126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1222 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  795    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  79.58 
 
 		 378 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  79.58 
 
 		 378 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  74.01 
 
 		 378 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  73.21 
 
 		 378 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  72.27 
 
 		 378 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  71.73 
 
 		 378 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  71.73 
 
 		 378 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  71.73 
 
 		 378 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  71.73 
 
 		 378 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  71.73 
 
 		 378 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  71.73 
 
 		 378 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  71.43 
 
 		 384 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  70.67 
 
 		 378 aa  557  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  68.44 
 
 		 378 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  58.79 
 
 		 378 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  58.79 
 
 		 378 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  53.7 
 
 		 380 aa  423  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  51.99 
 
 		 380 aa  395  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  34.92 
 
 		 380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  36 
 
 		 366 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 		 386 aa  202  7e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  32.9 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  32.76 
 
 		 397 aa  153  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  28.5 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  28.27 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  26.8 
 
 		 410 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  28.08 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  27.56 
 
 		 372 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  24.35 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  26.35 
 
 		 407 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  24.47 
 
 		 402 aa  96.3  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.67 
 
 		 375 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  26.81 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  24.88 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  24.49 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  26.35 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  23.27 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  22.31 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  31.94 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  24.44 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  24.23 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  31.72 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  22.86 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  24.81 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  22.79 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  21.59 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  23.8 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  22.19 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  22.11 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  22.17 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  23.54 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  23.59 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  24.63 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  23.87 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  22.67 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.86 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  26.32 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  20.58 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  21.97 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  22.98 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  22.64 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  24.89 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  22.31 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  20.92 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.9 
 
 		 843 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  22.36 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  19.81 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  21.54 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  23.36 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  22.42 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  22.17 
 
 		 397 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.82 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  24.61 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.02 
 
 		 646 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  29.77 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  20.92 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  22.53 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  22.83 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  21.81 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  21.36 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  24.66 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  20.25 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  21.31 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  27.4 
 
 		 362 aa  47.8  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  23.81 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  21.16 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  23.08 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  24.44 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.11 
 
 		 648 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.11 
 
 		 648 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  21.71 
 
 		 381 aa  46.6  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.11 
 
 		 648 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  25 
 
 		 395 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  24.06 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  25.81 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.71 
 
 		 648 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>