111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04050 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04050  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  100 
 
 		 328 aa  613  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.057296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  41.86 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  42.11 
 
 		 355 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  37.26 
 
 		 361 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  35.4 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  35.39 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  38.65 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  38.72 
 
 		 357 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  37.5 
 
 		 368 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  38.46 
 
 		 351 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.55 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  35.41 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  25.49 
 
 		 354 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  25.49 
 
 		 354 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  25.49 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  24.93 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  25.49 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  25.21 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  24.44 
 
 		 354 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  25.21 
 
 		 354 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  32.58 
 
 		 375 aa  119  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  25.21 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  25.41 
 
 		 352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  23.85 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  22.38 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  21.79 
 
 		 350 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  24.65 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  21.88 
 
 		 362 aa  86.7  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  23.23 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  23.23 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  21.57 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  24.32 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  24.32 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  21.69 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  21.02 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  21.02 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  19.67 
 
 		 357 aa  67  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  20.74 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  24.23 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.89 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.9 
 
 		 418 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  24.43 
 
 		 416 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  28.91 
 
 		 401 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  29.23 
 
 		 401 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  24.73 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3720  hypothetical protein  32.29 
 
 		 403 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3258  hypothetical protein  35.24 
 
 		 399 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2862  hypothetical protein  31.87 
 
 		 405 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  31.4 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  42.31 
 
 		 848 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 		 395 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  28.1 
 
 		 366 aa  49.3  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  33.86 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  29.25 
 
 		 846 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  24.87 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  21.83 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  27.82 
 
 		 401 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  27.27 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  34.11 
 
 		 838 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  28.46 
 
 		 399 aa  46.6  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  25.19 
 
 		 399 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  29.23 
 
 		 409 aa  46.2  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  28.46 
 
 		 399 aa  46.2  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  30.17 
 
 		 401 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  26.49 
 
 		 385 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  31.62 
 
 		 408 aa  46.2  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3827  hypothetical protein  29.71 
 
 		 408 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  27.7 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  31.54 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0609  protein of unknown function DUF214  23.85 
 
 		 422 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000928533  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  26.55 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1470  hypothetical protein  31.88 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.61 
 
 		 817 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  26.15 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  26.15 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  26.15 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0725  hypothetical protein  33.01 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  27.27 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  26.15 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  34.43 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 		 408 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  30.97 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  29.14 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4070  hypothetical protein  37.5 
 
 		 404 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  20.3 
 
 		 395 aa  43.9  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  25.66 
 
 		 400 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  38.38 
 
 		 866 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  39.51 
 
 		 408 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  33.04 
 
 		 397 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  25 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  22.11 
 
 		 397 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  30.23 
 
 		 434 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05510  cell division protein  26.83 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25 
 
 		 371 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  28.46 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>