144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1360 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  100 
 
 
401 aa  805    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  84.75 
 
 
399 aa  676    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  94.26 
 
 
401 aa  768    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  94.26 
 
 
401 aa  768    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  87.28 
 
 
401 aa  707    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  94.26 
 
 
401 aa  768    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  92.52 
 
 
401 aa  754    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  84.5 
 
 
399 aa  674    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  85.04 
 
 
401 aa  697    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  84.04 
 
 
401 aa  671    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  93.52 
 
 
401 aa  763    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  78.86 
 
 
401 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  74.06 
 
 
397 aa  598  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  73.07 
 
 
397 aa  590  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  76.56 
 
 
399 aa  588  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  75.31 
 
 
400 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  71.07 
 
 
400 aa  555  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  72.57 
 
 
400 aa  556  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  73.07 
 
 
397 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  71.22 
 
 
406 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  72.07 
 
 
400 aa  531  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  72.82 
 
 
397 aa  534  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  42.08 
 
 
400 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  41.83 
 
 
400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  40.55 
 
 
381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  42.43 
 
 
399 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  42.33 
 
 
400 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  38.37 
 
 
400 aa  279  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  38.6 
 
 
377 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  36.27 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  39.25 
 
 
380 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  34.34 
 
 
381 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  26.43 
 
 
349 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  25.87 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.76 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  22.95 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  26.54 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  22.71 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  22.46 
 
 
354 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  23.19 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  23.19 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  22.82 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  22.46 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  22.22 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  22.22 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  22.2 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  27.89 
 
 
366 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  21.13 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  22.6 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  25.63 
 
 
414 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  28.16 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  30.73 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  25.06 
 
 
376 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  19.67 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  19.67 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  21.74 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  23.17 
 
 
362 aa  57.4  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  27.65 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  24.36 
 
 
352 aa  53.9  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  22.89 
 
 
400 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  26.32 
 
 
385 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  23.11 
 
 
351 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  23.11 
 
 
351 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  22.56 
 
 
402 aa  53.5  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  34.26 
 
 
376 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  31.67 
 
 
388 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  33.93 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  21.46 
 
 
415 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  26.37 
 
 
389 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  21.17 
 
 
374 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  33.02 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  30.28 
 
 
411 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  18.4 
 
 
350 aa  50.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  24.37 
 
 
389 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  33.06 
 
 
378 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  28.06 
 
 
452 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  26.14 
 
 
392 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.48 
 
 
397 aa  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 
372 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  21.69 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  27.41 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  30 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  22.03 
 
 
378 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  29.17 
 
 
348 aa  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  32.5 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  31.3 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 
414 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  25.73 
 
 
389 aa  47.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  29.93 
 
 
852 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  25.29 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 
443 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  20.15 
 
 
349 aa  47  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.13 
 
 
809 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  26.02 
 
 
389 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  31.3 
 
 
390 aa  47  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  21.76 
 
 
395 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  31.82 
 
 
410 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  25.65 
 
 
402 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  23.31 
 
 
409 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>