161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1808 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  100 
 
 		 366 aa  738    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  48.77 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  46.47 
 
 		 380 aa  342  9e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  45.65 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  45.45 
 
 		 386 aa  328  7e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  37.1 
 
 		 381 aa  259  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  38.75 
 
 		 378 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  38.48 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  38.44 
 
 		 378 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  38.71 
 
 		 378 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  38.71 
 
 		 378 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  38.71 
 
 		 378 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  38.71 
 
 		 378 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  38.44 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  37.67 
 
 		 384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  36.56 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  36.36 
 
 		 378 aa  228  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  36.59 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  36.04 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  36.04 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  34.69 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  34.69 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  36 
 
 		 398 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  37.27 
 
 		 397 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  35.23 
 
 		 380 aa  186  8e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.54 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  31.25 
 
 		 407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  30 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  31.97 
 
 		 376 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  28.42 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  28.53 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  28.69 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  27.43 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  26.98 
 
 		 377 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  26.61 
 
 		 392 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  24.93 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  24.49 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  23.86 
 
 		 384 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  23.04 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  24.66 
 
 		 385 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  25.08 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  22.04 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  33.7 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  26.72 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  23.24 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  30.26 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  24.4 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  24.47 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  28 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  23.39 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  27.56 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  32.76 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  27.6 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  24.53 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  28.95 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  28.95 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  28.95 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  22.19 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  22.11 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  28.32 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  27.89 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  23.31 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  23.91 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  25.62 
 
 		 397 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  21.93 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  23.7 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  21.37 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  29.55 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  28.65 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  26.97 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  28.11 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  27.84 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  22.61 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  25.88 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  23.47 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  25.43 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  23.29 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  21.78 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  23.77 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  20.42 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  28.03 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  23.48 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  23.29 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  21.54 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  23.38 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  28.41 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  23.38 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.18 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  22.89 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  22.28 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  26.01 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>