164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1835 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  84.5 
 
 		 401 aa  674    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  99.25 
 
 		 399 aa  794    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  84 
 
 		 401 aa  676    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  84.75 
 
 		 401 aa  682    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  84.75 
 
 		 401 aa  682    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  83.75 
 
 		 401 aa  676    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  84.75 
 
 		 401 aa  682    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  83.5 
 
 		 401 aa  667    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  798    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  82.25 
 
 		 401 aa  653    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  81 
 
 		 401 aa  621  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  77.75 
 
 		 401 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  72.43 
 
 		 397 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  74.44 
 
 		 399 aa  567  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  71.18 
 
 		 397 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  72.43 
 
 		 400 aa  551  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  72.5 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  71.08 
 
 		 406 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  73.68 
 
 		 400 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  67.92 
 
 		 400 aa  531  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  70.5 
 
 		 397 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  71.68 
 
 		 400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  44.03 
 
 		 400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  43.53 
 
 		 400 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  43.28 
 
 		 400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  40.35 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  42.54 
 
 		 399 aa  289  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  39.55 
 
 		 400 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  38.25 
 
 		 377 aa  269  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  39.45 
 
 		 380 aa  258  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  37 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  34.67 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  26.6 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.29 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  26.43 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  21.87 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  21.86 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  24.02 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  21.43 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  21.18 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  21.43 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  21.41 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  28.11 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  20.94 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  21.18 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  21.87 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  21.65 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  24.66 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  20.94 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  20.94 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  24.45 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  22.04 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  22.68 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  22.68 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  24.75 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  21.36 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  20.78 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  21.29 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  21.29 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  23.21 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  21.32 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  25.14 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  30.3 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  22.12 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  25.71 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  24.65 
 
 		 409 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.73 
 
 		 646 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  26.49 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.18 
 
 		 648 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 		 443 aa  53.5  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  26.47 
 
 		 384 aa  53.1  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  21.8 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  26.92 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  22.52 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  26.54 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  24.32 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.63 
 
 		 648 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  25.73 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  26.21 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  32.43 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  24.92 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  33.04 
 
 		 376 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  24.18 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.7 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  17.28 
 
 		 349 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.08 
 
 		 648 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  22.04 
 
 		 791 aa  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  23.08 
 
 		 648 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  23.08 
 
 		 648 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.08 
 
 		 648 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  23.08 
 
 		 648 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  32.56 
 
 		 841 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.08 
 
 		 648 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  22.94 
 
 		 395 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  31.86 
 
 		 855 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  26.4 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.53 
 
 		 648 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  40.79 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>